Proprietà di scala della biodiversità in comunità microbiche

Uno dei problemi aperti in Ecologia è quello di caratterizzare la biodiversità di un ecosistema stimandola attraverso censimenti locali, che tipicamente coprono solamente una minima percentuale dell'area su cui si estende il sistema in esame. In questa tesi, verranno presentati alcuni dei metodi proposti in letteratura per superare tale problema, con particolare attenzione ad un modello di upscaling presentato nell'articolo "Upscaling species richness and abundances in tropical forests", recentemente pubblicato su Science Advances. Dopo aver testato l'affidabilità dei modelli proposti, applicheremo per la prima volta il metodo di upscaling per lo studio della biodiversità in comunità microbiche, utilizzando dati di metagenomica relativi ai batteri dell'intestino umano. One of the open issues in Ecology is how to extrapolate species richness from the local to the whole ecosystem scale. In fact for practical reasons only local-scale informations are available. In this thesis we we will discuss some upscaling methods, focusing on the method presented in the article "Upscaling species richness and abundances in tropical forests", recently published in Science Advances. The problem of predicting biodiversity also exists in microbial communities. After testing the upscaling methods on metagenomic's datasets, we will apply for the very first time the upscaling method to infer biodiversity in microbial communities using metagenomic's data concerning bacterials in human gut.