Isolamento di marcatori intronici in Acipenseridi e analisi di segregazione allelica mediante microsatelliti nello storione cobice (Acipenser naccarii)

Vista la recente disponibilità di nuovi gruppi familiari che si sono rivelati informativi per l’analisi di segregazione a nuovi loci non analizzati precedentemente, abbiamo voluto estendere lo studio della segregazione allelica a nuovi microsatelliti. Un’informazione più completa e più estesa delle modalità di segregazione in questa specie, rispetto a quella attualmente disponibile, è di grande rilevanza per la messa a punto di metodi analitici di gestione della diversità ex situ e per la definizione di piani di incrocio. Inoltre, allo scopo di integrare le informazioni ottenute mediante i microsatelliti con marcatori alternativi, sugli stessi gruppi famigliari è stato messo a punto un protocollo di caratterizzazione di regioni introniche ipervariabili con lo scopo finale di studiare anche per questi il pattern di segregazione. In questo contesto, questo lavoro di tesi ha avuto come obiettivo lo sviluppo di un protocollo per l’amplificazione e il successivo sequenziamento di specifici marcatori intronici, partendo dall’allineamento del genoma di Acipenser ruthenus e i trascrittomi di quattro diverse specie di storioni (Acipenser naccarii, Acipenser stellatus, Acipenser fulvescens, e Acipenser dabrianus). L’analisi dei risultati del sequenziamento si è limitata ad un’osservazione preliminare dei risultati del sequenziamento e della distribuzione dei vari loci all’interno delle diverse specie, senza entrare nel dettaglio dei pattern di segregazione allelico tra genitori e figli, tuttavia, la grande quantità di informazione raccolta consentirà in un prossimo futuro di avere risultati ottenuti con entrambi i marcatori molecolari per verificarne la coerenza e testarne la validità. Questi marcatori intronici, inoltre, risulteranno utili in futuro per l’analisi di variabilità genetica interspecifica all’interno della famiglia degli Acipenseridae, allo scopo di isolare marcatori diagnostici per l’identificazione di specie e di ibridi interspecifici.