CD49d, the α4 chain of the VLA-4 integrin, is a negative prognostic marker in chronic lymphocytic leukemia (CLL). Its expression is heterogeneous and ~20% of CLL patients show a bimodal pattern with coexisting CD49d+ and CD49d- cellular subpopulations. In patients with CD49d bimodal expression, the clinical course is comparable to unimodal positive cases, with a progressive increase of the CD49d+ fraction, particularly after therapy. The aim of the study is to investigate a possible role of epigenetic mechanisms in the regulation of CD49d expression. Chromatin accessibility analysis revealed that upstream regions of ITGA4 were more accessible in CD49d+ cells, enriched in motif sites of transcription factors relevant to B-cell biology, which were confirmed by ChIP-qPCR in the CD49d+ HG-3 cell line. Analysis of histone modifications in primary CLL samples with different CD49d expression patterns, revealed an epigenetic profile consistent with permissive chromatin states in CD49d+ cells. Furthermore, treatment of the HG-3 cell line with histone acetyltransferase and BRD4 inhibitors resulted in a marked reduction of CD49d expression. In conclusion, these findings provide insight into chromatin-based mechanisms controlling CD49d expression and highlight the therapeutic potential of targeting this regulatory axis with epigenetic inhibitors.

CD49d, subunità α4 dell’integrina VLA-4, rappresenta un marcatore prognostico negativo nella leucemia linfatica cronica (LLC). L’espressione è variabile e circa il 20% dei pazienti presenta un pattern di espressione bimodale, caratterizzato dalla coesistenza di sottopopolazioni cellulari CD49d+ e CD49d-. Nei pazienti con espressione bimodale l’andamento clinico è sovrapponibile a quello dei casi unimodali positivi, con progressivo aumento della componente cellulare positiva, in particolare dopo terapia. L’obiettivo dello studio è indagare un possibile ruolo dei meccanismi epigenetici nella regolazione dell’espressione di CD49d. L’analisi di accessibilità cromatinica ha rilevato nelle cellule CD49d+ regioni a monte del gene ITGA4 maggiormente accessibili, arricchite per siti di legame di fattori di trascrizione rilevanti per la biologia delle cellule B, confermati tramite ChIP-qPCR nella linea cellulare HG-3. Analisi delle modificazioni istoniche su campioni primari di LLC con differente pattern d’espressione di CD49d hanno evidenziato, nelle cellule CD49d+, un profilo epigenetico compatibile con uno stato cromatinico permissivo. Inoltre, il trattamento della linea HG-3 con inibitori delle istone acetiltransferasi e di BRD4 ha determinato una marcata riduzione dell’espressione di CD49d. In conclusione, l’espressione e l’espansione della componente CD49d+ risultano sostenute da un contesto epigenetico attivo, potenzialmente modulabile a fini terapeutici.

Meccanismi epigenetici di regolazione dell’espressione di CD49d nella leucemia linfatica cronica

MOZZILLO, ROSSELLA
2024/2025

Abstract

CD49d, the α4 chain of the VLA-4 integrin, is a negative prognostic marker in chronic lymphocytic leukemia (CLL). Its expression is heterogeneous and ~20% of CLL patients show a bimodal pattern with coexisting CD49d+ and CD49d- cellular subpopulations. In patients with CD49d bimodal expression, the clinical course is comparable to unimodal positive cases, with a progressive increase of the CD49d+ fraction, particularly after therapy. The aim of the study is to investigate a possible role of epigenetic mechanisms in the regulation of CD49d expression. Chromatin accessibility analysis revealed that upstream regions of ITGA4 were more accessible in CD49d+ cells, enriched in motif sites of transcription factors relevant to B-cell biology, which were confirmed by ChIP-qPCR in the CD49d+ HG-3 cell line. Analysis of histone modifications in primary CLL samples with different CD49d expression patterns, revealed an epigenetic profile consistent with permissive chromatin states in CD49d+ cells. Furthermore, treatment of the HG-3 cell line with histone acetyltransferase and BRD4 inhibitors resulted in a marked reduction of CD49d expression. In conclusion, these findings provide insight into chromatin-based mechanisms controlling CD49d expression and highlight the therapeutic potential of targeting this regulatory axis with epigenetic inhibitors.
2024
Epigenetic mechanisms regulating CD49d expression in chronic lymphocytic leukemia
CD49d, subunità α4 dell’integrina VLA-4, rappresenta un marcatore prognostico negativo nella leucemia linfatica cronica (LLC). L’espressione è variabile e circa il 20% dei pazienti presenta un pattern di espressione bimodale, caratterizzato dalla coesistenza di sottopopolazioni cellulari CD49d+ e CD49d-. Nei pazienti con espressione bimodale l’andamento clinico è sovrapponibile a quello dei casi unimodali positivi, con progressivo aumento della componente cellulare positiva, in particolare dopo terapia. L’obiettivo dello studio è indagare un possibile ruolo dei meccanismi epigenetici nella regolazione dell’espressione di CD49d. L’analisi di accessibilità cromatinica ha rilevato nelle cellule CD49d+ regioni a monte del gene ITGA4 maggiormente accessibili, arricchite per siti di legame di fattori di trascrizione rilevanti per la biologia delle cellule B, confermati tramite ChIP-qPCR nella linea cellulare HG-3. Analisi delle modificazioni istoniche su campioni primari di LLC con differente pattern d’espressione di CD49d hanno evidenziato, nelle cellule CD49d+, un profilo epigenetico compatibile con uno stato cromatinico permissivo. Inoltre, il trattamento della linea HG-3 con inibitori delle istone acetiltransferasi e di BRD4 ha determinato una marcata riduzione dell’espressione di CD49d. In conclusione, l’espressione e l’espansione della componente CD49d+ risultano sostenute da un contesto epigenetico attivo, potenzialmente modulabile a fini terapeutici.
CLL
Epigenetic
CD49d
File in questo prodotto:
File Dimensione Formato  
Mozzillo_Rossella.pdf

Accesso riservato

Dimensione 2.37 MB
Formato Adobe PDF
2.37 MB Adobe PDF

The text of this website © Università degli studi di Padova. Full Text are published under a non-exclusive license. Metadata are under a CC0 License

Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/102195