Quest’elaborato di tesi si basa sul lavoro inerente alla messa a punto di un protocollo sperimentale di DNA ambientale per l’identificazione di echinodermi ed altri invertebrati, a partire da campioni di acqua filtrata prelevati in vari siti della laguna di Venezia. Il lavoro si è concentrato sull’isolamento, estrazione e amplificazione di eDNA dai campioni acquatici, i quali sono stati in seguito sequenziati ed analizzati secondo le metodologie di metabarcoding. Il marcatore molecolare selezionato per questo lavoro di tesi è stato ricavato da Taberlet et al. (2018), ed è specifico per il Phylum degli echinodermi. L’obiettivo finale è stato quello di ottenere, attraverso l’analisi dei dati di sequenziamento a partire da campioni raccolti in un arco temporale che va dal 2018 al 2021, una panoramica delle specie di invertebrati presenti in laguna di Venezia. La metodologia messa a punto potrà essere utilizzata per il monitoraggio a lungo termine dei popolamenti presenti in laguna di Venezia e i risultati ottenuti potranno essere utilizzati come termine di confronto per cambiamenti rilevati nel tempo anche rispetto all’entrata del sistema MOSE nella fase pienamente operativa.

Analisi del DNA ambientale di echinodermi ed altri invertebrati presenti in laguna di Venezia

MARTINO, FRANCESCO
2021/2022

Abstract

Quest’elaborato di tesi si basa sul lavoro inerente alla messa a punto di un protocollo sperimentale di DNA ambientale per l’identificazione di echinodermi ed altri invertebrati, a partire da campioni di acqua filtrata prelevati in vari siti della laguna di Venezia. Il lavoro si è concentrato sull’isolamento, estrazione e amplificazione di eDNA dai campioni acquatici, i quali sono stati in seguito sequenziati ed analizzati secondo le metodologie di metabarcoding. Il marcatore molecolare selezionato per questo lavoro di tesi è stato ricavato da Taberlet et al. (2018), ed è specifico per il Phylum degli echinodermi. L’obiettivo finale è stato quello di ottenere, attraverso l’analisi dei dati di sequenziamento a partire da campioni raccolti in un arco temporale che va dal 2018 al 2021, una panoramica delle specie di invertebrati presenti in laguna di Venezia. La metodologia messa a punto potrà essere utilizzata per il monitoraggio a lungo termine dei popolamenti presenti in laguna di Venezia e i risultati ottenuti potranno essere utilizzati come termine di confronto per cambiamenti rilevati nel tempo anche rispetto all’entrata del sistema MOSE nella fase pienamente operativa.
2021
Environmental DNA analysis of echinoderms and other invertebrates present in the Venice lagoon
environmental DNA
echinodermi
Laguna di Venezia
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/10224