Questa tesi affronta il problema relativo alla rappresentazione compatta ed efficiente di insiemi di k-mer colorati. Ciò risulta utile in molte applicazioni bioinformatiche per il trattamento di dati genomici di dimensioni considerevoli in maniera pratica ed efficiente. Il lavoro analizza tecniche già esistenti e le utilizza per ovviare ad alcuni problemi dei metodi allo stato dell’arte. Le soluzioni adottate vengono valutate su dataset genomici al fine di analizzarne l’efficienza in termini di utilizzo della memoria e scalabilità.

Rappresentazioni Compatte ed Efficienti di Insiemi di k-mer Colorati

SQUARCINA, MARCO
2025/2026

Abstract

Questa tesi affronta il problema relativo alla rappresentazione compatta ed efficiente di insiemi di k-mer colorati. Ciò risulta utile in molte applicazioni bioinformatiche per il trattamento di dati genomici di dimensioni considerevoli in maniera pratica ed efficiente. Il lavoro analizza tecniche già esistenti e le utilizza per ovviare ad alcuni problemi dei metodi allo stato dell’arte. Le soluzioni adottate vengono valutate su dataset genomici al fine di analizzarne l’efficienza in termini di utilizzo della memoria e scalabilità.
2025
Compact and Efficient Representations of Colored k-mer Sets
colored
compact
k-mer
sets
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/106281