Ouroboros:un metodo per il riconoscimento e l'analisi delle proteine solenoidi

Il software Ouroboros, sviluppato come progetto di tesi sperimentale presso il laboratorio BioComputing UP, rappresenta un tentativo di indagine nell’ambito delle proteine solenoidi, ambito di recente sviluppo e di continua crescita. Le problematiche più consistenti, quando si considerano le proteine solenoid, riguardano principalmente l’inadeguatezza dei metodi classici di indagine nel fornire una descrizione completa per queste strutture proteiche. Il compito dei software di predizione, di cui Ouroboros fa parte, è quello di sopperire a queste mancanze, introducendo per l’appunto l’analisi predittiva e cercando di ottenere le informazioni necessarie a completare il quadro rappresentativo per questa famiglia di proteine. Le due investigazioni principali per le strutture solenoidi concernono l’individuazione e il distinguo rispetto alle proteine globulari e la determinazione dei periodi di ripetizione. Il software che viene qui descritto tenta un nuovo approccio per tentare di dare una risposta a questi interrogativi