La Systems Biology è una disciplina che mira a studiare i circuiti regolativi, a livello cellulare ed intra-cellulare, delle funzioni biologiche. L’attività di tesi ha riguardato lo studio di un semplice modello di trascrizione del DNA descrivendolo stocasticamente in termini di Chemical Master Equation da cui è stata ricavata la descrizione di potenza (convalidata anche con simulazioni di Gillespie). Inoltre è stata dimostrata la stazionarietà a regime del sistema. Nel contesto di dinamica veloce del fattore di trascrizione è stata ricavata la descrizione di Fokker-Planck potendo delineare un comportamento di tipo passa-basso del primo ordine. Inoltre è stata valutata la densità di probabilità e la proprietà di ergodicità. Infine dalla descrizione di Fokker – Planck è stata ricavata la descrizione in termini di Equazione Differenziale Stocastica convalidandone la validità descrittiva del modello considerato
Modelli stocastici della regolazione trascrizionale
Giaretta, Alberto
2012/2013
Abstract
La Systems Biology è una disciplina che mira a studiare i circuiti regolativi, a livello cellulare ed intra-cellulare, delle funzioni biologiche. L’attività di tesi ha riguardato lo studio di un semplice modello di trascrizione del DNA descrivendolo stocasticamente in termini di Chemical Master Equation da cui è stata ricavata la descrizione di potenza (convalidata anche con simulazioni di Gillespie). Inoltre è stata dimostrata la stazionarietà a regime del sistema. Nel contesto di dinamica veloce del fattore di trascrizione è stata ricavata la descrizione di Fokker-Planck potendo delineare un comportamento di tipo passa-basso del primo ordine. Inoltre è stata valutata la densità di probabilità e la proprietà di ergodicità. Infine dalla descrizione di Fokker – Planck è stata ricavata la descrizione in termini di Equazione Differenziale Stocastica convalidandone la validità descrittiva del modello consideratoFile | Dimensione | Formato | |
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https://hdl.handle.net/20.500.12608/16206