In questa tesi si analizzano tre approcci di tipo alignment free per trovare la similarità tra sequenze di DNA, MaxCor, AvCor e kACS. Sono stati realizzati un insieme di test per misurarne le performance su di un dataset di sequenze di DNA di tipo mitocondriale di 34 mammiferi. Gli esperimenti condotti hanno mostrato che l’introduzione di mismatch può essere efficacemente usata per effettuare analisi filogenetiche
Implementazione ed analisi di metodi alignment free con Mismatch
Bisello, Daniele
2015/2016
Abstract
In questa tesi si analizzano tre approcci di tipo alignment free per trovare la similarità tra sequenze di DNA, MaxCor, AvCor e kACS. Sono stati realizzati un insieme di test per misurarne le performance su di un dataset di sequenze di DNA di tipo mitocondriale di 34 mammiferi. Gli esperimenti condotti hanno mostrato che l’introduzione di mismatch può essere efficacemente usata per effettuare analisi filogeneticheFile in questo prodotto:
| File | Dimensione | Formato | |
|---|---|---|---|
|
tesi_Bisello_Daniele.pdf
accesso aperto
Dimensione
2.23 MB
Formato
Adobe PDF
|
2.23 MB | Adobe PDF | Visualizza/Apri |
The text of this website © Università degli studi di Padova. Full Text are published under a non-exclusive license. Metadata are under a CC0 License
Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento:
https://hdl.handle.net/20.500.12608/19225