Le nuove tecnologie di sequenziamento NGS e la riduzione dei costi associati, hanno portato negli ultimi anni a una produzione di grandi moli di dati genomici. Per fare fronte ai problemi legati alla loro gestione vengono utilizzati dei compressori lossy. Il più famoso è il software Quartz, che utilizza un dizionario di k-mer discriminativi. In questo lavoro di tesi è stata proposta una metodologia efficiente per la costruzione di tali dizionari

Ricerca efficiente di dizionari di k-mer discriminativi per la correzione di letture genomiche

Zinato, Paolo
2017/2018

Abstract

Le nuove tecnologie di sequenziamento NGS e la riduzione dei costi associati, hanno portato negli ultimi anni a una produzione di grandi moli di dati genomici. Per fare fronte ai problemi legati alla loro gestione vengono utilizzati dei compressori lossy. Il più famoso è il software Quartz, che utilizza un dizionario di k-mer discriminativi. In questo lavoro di tesi è stata proposta una metodologia efficiente per la costruzione di tali dizionari
2017-04-13
dizionari, k-mer, quartz, compressione, pipeline, reads, sequenziamento
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/25916