Il mio lavoro di tesi si è focalizzato sullo studio degli effetti del fosfato su diversi genotipi di Lotus japonicus con l’obiettivo di fare luce sui meccanismi molecolari coinvolti nell’omeostasi del fosfato. Per fare ciò è stata analizzata la risposta fenotipica delle radici di piante cresciute su terreni a diversi livelli di fosfato e sono state fatte misurazioni sui livelli di fosfato nei tessuti fogliari e radicali. Inoltre, sono stati analizzati gli apparati radicali e il loro sviluppo nel tempo. Con l’obiettivo di identificare possibili determinanti genetici alla base della variazione fenotipica osservata nella popolazione di Lotus japonicus, ci siamo focalizzati sul gene PLC2 che codifica per una fosfolipasi di tipo C2. La regione genomica comprendente il promotore di PLC2 è infatti risultata essere associata alla diversità fenotipica in risposta al fosfato. Per determinare l’impatto dei polimorfismi nucleotidici singoli (SNPs), abbiamo clonato e risequenziato i promotori rappresentativi della popolazione e analizzato la loro attività trascrizionale e l’impatto sulle concentrazioni di fosfato delle radici. Combinando analisi genetiche, saggi fenotipici e misurazioni del fosfato accumulato in radici, il lavoro di tesi ha permesso di svelare l’impatto di singoli polimorfismi nucleotidici sull’omeostasi del fosfato di Lotus japonicus.

Meccanismi molecolari nell' omeostasi del fosfato in Lotus japonicus: analisi della variabilità naturale di una fosfolipasi di tipo C2

CASTELLI, DANIELE
2021/2022

Abstract

Il mio lavoro di tesi si è focalizzato sullo studio degli effetti del fosfato su diversi genotipi di Lotus japonicus con l’obiettivo di fare luce sui meccanismi molecolari coinvolti nell’omeostasi del fosfato. Per fare ciò è stata analizzata la risposta fenotipica delle radici di piante cresciute su terreni a diversi livelli di fosfato e sono state fatte misurazioni sui livelli di fosfato nei tessuti fogliari e radicali. Inoltre, sono stati analizzati gli apparati radicali e il loro sviluppo nel tempo. Con l’obiettivo di identificare possibili determinanti genetici alla base della variazione fenotipica osservata nella popolazione di Lotus japonicus, ci siamo focalizzati sul gene PLC2 che codifica per una fosfolipasi di tipo C2. La regione genomica comprendente il promotore di PLC2 è infatti risultata essere associata alla diversità fenotipica in risposta al fosfato. Per determinare l’impatto dei polimorfismi nucleotidici singoli (SNPs), abbiamo clonato e risequenziato i promotori rappresentativi della popolazione e analizzato la loro attività trascrizionale e l’impatto sulle concentrazioni di fosfato delle radici. Combinando analisi genetiche, saggi fenotipici e misurazioni del fosfato accumulato in radici, il lavoro di tesi ha permesso di svelare l’impatto di singoli polimorfismi nucleotidici sull’omeostasi del fosfato di Lotus japonicus.
2021
Molecular mechanisms in Lotus japonicus phosphate homeostasis: analysis of the natural variation of a phospholipase C2
omeostasi fosfato
radici
fosfolipasi C2
simbiosi micorrizica
Lotus japonicus
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