I disordini del neurosviluppo (NDDs) sono una classe di patologie ad esordio precoce che colpiscono la crescita e la funzionalità cerebrale e interessano più del 3% dei bambini su scala mondiale. Questi disordini presentano un’estrema eterogeneità sia clinica che genetica. Nonostante l’impiego delle tecniche di sequenziamento di nuova generazione abbia portato alla possibilità di analizzare molti geni contemporaneamente, l’analisi delle sole varianti a singolo nucleotide (SNVs) dei geni implicati nei NDDs non porta alla diagnosi molecolare in tutti i pazienti. Un’ulteriore categoria di varianti importanti nel contesto di questi disturbi è quella delle copy number variations (CNVs). Si tratta di sequenze di DNA ripetute, che variano nel numero di copie in individui diversi. Lo scopo di questo progetto è stato quello di determinare l’impatto dell’analisi delle CNVs in pazienti con NDDs. È stata condotta l’analisi delle CNVs su 100 esomi di pazienti affetti da NDDs, negativi alla precedente ricerca di SNVs mediante whole exome sequencing (WES). L’analisi ha portato all’individuazione bioinformatica di una variante CNV significativa in 10 dei pazienti analizzati, confermata successivamente mediante real-time PCR o array-CGH. Questo lavoro ha portato ad un aumento del 10% della detection rate nei pazienti analizzati, confermando l’importanza dell’analisi delle CNVs nei NDDs.
Impatto dell'analisi delle copy number variations (CNVs) nella diagnosi molecolare dei disordini del neurosviluppo
CHIAROTTO, ELEONORA
2021/2022
Abstract
I disordini del neurosviluppo (NDDs) sono una classe di patologie ad esordio precoce che colpiscono la crescita e la funzionalità cerebrale e interessano più del 3% dei bambini su scala mondiale. Questi disordini presentano un’estrema eterogeneità sia clinica che genetica. Nonostante l’impiego delle tecniche di sequenziamento di nuova generazione abbia portato alla possibilità di analizzare molti geni contemporaneamente, l’analisi delle sole varianti a singolo nucleotide (SNVs) dei geni implicati nei NDDs non porta alla diagnosi molecolare in tutti i pazienti. Un’ulteriore categoria di varianti importanti nel contesto di questi disturbi è quella delle copy number variations (CNVs). Si tratta di sequenze di DNA ripetute, che variano nel numero di copie in individui diversi. Lo scopo di questo progetto è stato quello di determinare l’impatto dell’analisi delle CNVs in pazienti con NDDs. È stata condotta l’analisi delle CNVs su 100 esomi di pazienti affetti da NDDs, negativi alla precedente ricerca di SNVs mediante whole exome sequencing (WES). L’analisi ha portato all’individuazione bioinformatica di una variante CNV significativa in 10 dei pazienti analizzati, confermata successivamente mediante real-time PCR o array-CGH. Questo lavoro ha portato ad un aumento del 10% della detection rate nei pazienti analizzati, confermando l’importanza dell’analisi delle CNVs nei NDDs.File | Dimensione | Formato | |
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https://hdl.handle.net/20.500.12608/42294