In questo elaborato viene trattata la simulazione di un sistema di rilevamento delle interazioni tra le cellule dendritiche e cellule T, componenti del sistema immunitario il cui compito è quello di degradare agenti patogeni entrati nel nostro corpo. La simulazione cerca di riprodurre il funzionamento di una tecnica sviluppata da un gruppo di ricercatori e presente in letteratura chiamata LIPSTIC: tale sistema ingegnerizzato utilizza un fluoroforo come etichetta rilevabile dell’interazione tra le due cellule, sfruttando l’aumento di probabilità di passaggio del fluoroforo da una cellula all’altra in caso di avvenuta interazione. Tramite l’utilizzo della piattaforma Matlab, il simulatore sviluppato permette di far vedere attraverso un video le cellule che si muovono ed interagiscono tra loro passandosi, il fluoroforo. Sono state quindi stimate quante interazioni e passaggi di fluoroforo avvengono (veri positivi) e calcolate la sensibilità, specificità e precisione del sistema. I risultati ottenuti mostrano che tale simulazione è una buona rappresentazione dell’approccio LIPSTIC.
Simulazione delle interazioni tra cellule dendritiche e cellule T del sistema immunitario durante un esperimento di labeling enzimatico
DE ROSSI, GIULIA
2022/2023
Abstract
In questo elaborato viene trattata la simulazione di un sistema di rilevamento delle interazioni tra le cellule dendritiche e cellule T, componenti del sistema immunitario il cui compito è quello di degradare agenti patogeni entrati nel nostro corpo. La simulazione cerca di riprodurre il funzionamento di una tecnica sviluppata da un gruppo di ricercatori e presente in letteratura chiamata LIPSTIC: tale sistema ingegnerizzato utilizza un fluoroforo come etichetta rilevabile dell’interazione tra le due cellule, sfruttando l’aumento di probabilità di passaggio del fluoroforo da una cellula all’altra in caso di avvenuta interazione. Tramite l’utilizzo della piattaforma Matlab, il simulatore sviluppato permette di far vedere attraverso un video le cellule che si muovono ed interagiscono tra loro passandosi, il fluoroforo. Sono state quindi stimate quante interazioni e passaggi di fluoroforo avvengono (veri positivi) e calcolate la sensibilità, specificità e precisione del sistema. I risultati ottenuti mostrano che tale simulazione è una buona rappresentazione dell’approccio LIPSTIC.File | Dimensione | Formato | |
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https://hdl.handle.net/20.500.12608/47646