In questa tesi sono state effettuate analisi di genetica di popolazione nel gò (Zosterisessor ophiocephalus) nelle lagune dell’alto Adriatico, Marano, Goro e Venezia, attraverso l’utilizzo di marcatori mitocondriali. Questo lavoro di tesi prosegue quello di tesi precedenti, effettuato con marcatori nucleari microsatelliti, in cui è stata rilevata una bassa variabilità genetica, legata ad una dimensione effettiva di popolazione molto piccola, e la presenza di variabilità genetica temporale. Inizialmente sono state analizzate con i marcatori mitocondriali, 53 coppie di gò, che sono risultate coppie di fratelli (fullsibs) attraverso l’utilizzo di 10 loci microsatellite. È stata sequenziata la regione del D-loop (corrispondente a 849 bp) di 122 individui (103 probabili fratelli e 19 individui non imparentati sulla base delle analisi nucleari) per identificare gli aplotipi di ciascuno di essi, al fine di determinare se le relazioni di parentela assegnate grazie ai microsatelliti fossero confermate. Molte coppie di probabili fratelli, tuttavia, presentavano aplotipi diversi ed il Test di Fisher ha rilevato che la frequenza con cui coppie di potenziali fratelli condividevano lo stesso aplotipo mitocondriale non differiva significativamente da quanto atteso per caso. Complessivamente le analisi mitocondriali hanno rilevato un livello di variabilità genetica molto più elevata di quella osservata a livello nucleare, risultato che ha fornito una dimensione effettiva della popolazione femminile di circa 200000 individui. Attraverso l’utilizzo dei test di neutralità e l’analisi della Mismatch Distribution, si è potuto determinare che la popolazione è andata incontro a fenomeni di variazione demografica (espansione) nell’ultimo postglaciale. Infatti, attraverso la calibrazione di un orologio molecolare specifico, è stato possibile datare l’espansione a circa 20000 - 10000 anni fa. Il dato ottenuto è stato confrontato con quello di altri organismi di habitat lagunari comparabili e discusso rispetto ai risultati ottenuti in precedenza con i marcatori nucleari.

Stima della dimensione effettiva della popolazione di Zosterisessor ophiocephalus nella laguna di Venezia. Analisi di genetica di popolazione attraverso l'uso di marcatori mitocondriali e nucleari

QUEIROLO, ELISA
2022/2023

Abstract

In questa tesi sono state effettuate analisi di genetica di popolazione nel gò (Zosterisessor ophiocephalus) nelle lagune dell’alto Adriatico, Marano, Goro e Venezia, attraverso l’utilizzo di marcatori mitocondriali. Questo lavoro di tesi prosegue quello di tesi precedenti, effettuato con marcatori nucleari microsatelliti, in cui è stata rilevata una bassa variabilità genetica, legata ad una dimensione effettiva di popolazione molto piccola, e la presenza di variabilità genetica temporale. Inizialmente sono state analizzate con i marcatori mitocondriali, 53 coppie di gò, che sono risultate coppie di fratelli (fullsibs) attraverso l’utilizzo di 10 loci microsatellite. È stata sequenziata la regione del D-loop (corrispondente a 849 bp) di 122 individui (103 probabili fratelli e 19 individui non imparentati sulla base delle analisi nucleari) per identificare gli aplotipi di ciascuno di essi, al fine di determinare se le relazioni di parentela assegnate grazie ai microsatelliti fossero confermate. Molte coppie di probabili fratelli, tuttavia, presentavano aplotipi diversi ed il Test di Fisher ha rilevato che la frequenza con cui coppie di potenziali fratelli condividevano lo stesso aplotipo mitocondriale non differiva significativamente da quanto atteso per caso. Complessivamente le analisi mitocondriali hanno rilevato un livello di variabilità genetica molto più elevata di quella osservata a livello nucleare, risultato che ha fornito una dimensione effettiva della popolazione femminile di circa 200000 individui. Attraverso l’utilizzo dei test di neutralità e l’analisi della Mismatch Distribution, si è potuto determinare che la popolazione è andata incontro a fenomeni di variazione demografica (espansione) nell’ultimo postglaciale. Infatti, attraverso la calibrazione di un orologio molecolare specifico, è stato possibile datare l’espansione a circa 20000 - 10000 anni fa. Il dato ottenuto è stato confrontato con quello di altri organismi di habitat lagunari comparabili e discusso rispetto ai risultati ottenuti in precedenza con i marcatori nucleari.
2022
Effective population size estimation of Zosterisessor ophiocephalus in the Venice lagoon. A population genetics analysis using mitochondrial and nuclear markers
Z. ophiocephalus
Analisi genetica
Marcatori molecolari
File in questo prodotto:
Non ci sono file associati a questo prodotto.

The text of this website © Università degli studi di Padova. Full Text are published under a non-exclusive license. Metadata are under a CC0 License

Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/50263