Mitogenomica comparativa ed evoluzionistica del genere Ostrea (Ostreidae, Bivalvia) con particolare riferimento ad Ostrea stentina

Ostrea stentina Payraudeau, 1826 is a species of oyster of low commercial interest because of its small dimensions. The molecular data on this species are limited. In this thesis, the first ever complete sequences of mitochondrial DNA (mitogenome) of O. stentina have been analyzed. The sequences come from specimens gathered in the Venice lagoon. Initial analysis, done on the barcoding part of the cox1 gene, of the sequences from the specimens from the lagoon and from other samples available in GenBank, let us find three well discrete groups, at a worldwide level, of haplotypes of O. stentina. The analysis conducted on the three mitogenomes of O. stentina indicate a good intraspecific variability.The analysis of evolutionistic and comparative mitogenomics show that the gene order of O. stentina is the same as all other species of Ostreinae sequenced until now. Filomitogenomic analysis place O. stentina as a sister group of Ostrea lurida and highlight that the Ostrea genus, as currently defined is polyphyletic.

Ostrea stentina Payraudeau, 1826 è una specie di ostrica dal limitato interesse commerciale a causa delle sue piccole dimensioni. I dati molecolari su questa specie sono limitati. In questa tesi sono state studiate le prime sequenze complete del genoma mitocondriale (mitogenoma) di O. stentina. Le sequenze sono state ottenute da esemplari raccolti nella laguna di Venezia. Un’iniziale analisi, basata sulla porzione barcoding del gene cox1, delle sequenze dei campioni della laguna e di altri campioni disponibili in GenBank, hanno consentito di individuare tre gruppi ben separati, a livello mondiale, di aplotipi di O. stentina. Le analisi condotte sui tre mitogenomi di O. stentina indicano una buona variabilità intraspecifica. Le analisi di mitogenomica evoluzionistica e comparativa mostrano che il gene order di O. stentina è lo stesso di tutte le altre specie di Ostreinae sequenziate fino ad oggi. Le analisi filomitogenomiche posizionano O. stentina come sister group di Ostrea lurida e evidenziano che il genere Ostrea come attualmente definito, è polifiletico.