Ci sono diversi modi per analizzare dinamiche stocastiche legate alla genetica. Ponendosi all'interno dell'ambito dei processi di Markov e dei problemi di martingala è possibile, partendo da una popolazione dove il numero di individui rimane costante nelle generazioni, calcolare la frequenza con cui si presenteranno diverse caratteristiche all’interno di un campione o, in alternativa, conoscendo le proprietà genetiche e la dinamica del modello, studiarne la genealogia. La discussione, passando per digressioni che nascono in maniera naturale, ad esempio la possibilità di mutazione, di selezione o la presenza di infiniti alleli, si concentra specialmente nel considerare processi stocastici che sorgono quando il numero di individui tende ad infinito. Si derivano quindi l'interpretazione e le proprietà matematiche dei processi di Wright-Fisher, Lambda-Fleming-Viot, e dei relativi processi coalescenti, con enfasi particolare sulle relazioni di dualità che vi sussistono.

Coalescenza e dualità per processi di Wright-Fisher e Lambda-Fleming-Viot

CARNOVICH, SAMUELE
2023/2024

Abstract

Ci sono diversi modi per analizzare dinamiche stocastiche legate alla genetica. Ponendosi all'interno dell'ambito dei processi di Markov e dei problemi di martingala è possibile, partendo da una popolazione dove il numero di individui rimane costante nelle generazioni, calcolare la frequenza con cui si presenteranno diverse caratteristiche all’interno di un campione o, in alternativa, conoscendo le proprietà genetiche e la dinamica del modello, studiarne la genealogia. La discussione, passando per digressioni che nascono in maniera naturale, ad esempio la possibilità di mutazione, di selezione o la presenza di infiniti alleli, si concentra specialmente nel considerare processi stocastici che sorgono quando il numero di individui tende ad infinito. Si derivano quindi l'interpretazione e le proprietà matematiche dei processi di Wright-Fisher, Lambda-Fleming-Viot, e dei relativi processi coalescenti, con enfasi particolare sulle relazioni di dualità che vi sussistono.
2023
Coalescence and duality for Wright-Fisher and Lambda-Fleming-Viot's processes
Wright-Fisher
Lambda-Fleming-Viot
Dualità
Kingman's Coalescent
Lambda-Coalescent
File in questo prodotto:
File Dimensione Formato  
Carnovich_Samuele.pdf

accesso riservato

Dimensione 1.27 MB
Formato Adobe PDF
1.27 MB Adobe PDF

The text of this website © Università degli studi di Padova. Full Text are published under a non-exclusive license. Metadata are under a CC0 License

Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/61992