Uno degli aspetti più interessanti dell'analisi di dati a singola cellula è lo l'analisi pseudotemporale. A partire da alcuni dati provenienti da un esperimento per capire il processo di maturazione delle cellule staminali, è stata effettuata un'analisi preliminare ed esplorativa. Una volta introdotti alcuni metodi ed algoritmi per lo studio di reti statiche per la stima delle relazioni tra geni, sono stati applicati dei modelli per reti dinamiche al fine di comprendere il modo in cui tale relazione cambia lungo la traiettoria pseudotemporale.

Analisi di reti dinamiche in contesto single-cell RNA-seq

TREVISAN, PIERO
2023/2024

Abstract

Uno degli aspetti più interessanti dell'analisi di dati a singola cellula è lo l'analisi pseudotemporale. A partire da alcuni dati provenienti da un esperimento per capire il processo di maturazione delle cellule staminali, è stata effettuata un'analisi preliminare ed esplorativa. Una volta introdotti alcuni metodi ed algoritmi per lo studio di reti statiche per la stima delle relazioni tra geni, sono stati applicati dei modelli per reti dinamiche al fine di comprendere il modo in cui tale relazione cambia lungo la traiettoria pseudotemporale.
2023
Analysis of dynamic networks in single-cell RNA-seq context
Pseudotempo
Reti
Lasso
Cellule
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/64215