I recenti progressi nelle tecnologie di trascittomica spaziale basate sull'imaging consentono ora la profilazione ad alto rendimento dei geni mirati e delle loro posizioni nei tessuti fissi. In particolare si riesce ad ottenere una vastità di informazioni partendo da un campione di tessuto tra cui anche l'informazione spaziale. L'obiettivo è utilizzare delle tecniche di clustering per provare ad identificare dei cluster sulla base dei dati ottenuti dal tessuto. In particolare si vanno a confrontare tecniche di clustering supervisionato e non supervisionato classiche sia tecniche più recenti che sfruttano anche l'informazione spaziale che si riesce ad ottenere con le nuove tecniche di sequenziamento.

Metodi di Cluster Analysis per dati single cell: campioni cellulari di fegato

MADONNA, DOMENICO
2023/2024

Abstract

I recenti progressi nelle tecnologie di trascittomica spaziale basate sull'imaging consentono ora la profilazione ad alto rendimento dei geni mirati e delle loro posizioni nei tessuti fissi. In particolare si riesce ad ottenere una vastità di informazioni partendo da un campione di tessuto tra cui anche l'informazione spaziale. L'obiettivo è utilizzare delle tecniche di clustering per provare ad identificare dei cluster sulla base dei dati ottenuti dal tessuto. In particolare si vanno a confrontare tecniche di clustering supervisionato e non supervisionato classiche sia tecniche più recenti che sfruttano anche l'informazione spaziale che si riesce ad ottenere con le nuove tecniche di sequenziamento.
2023
Cluster Analysis methods for single cell data: liver cell data
Clustering
single cell
Cluster Analysis
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