Peptidi coiled-coil contenenti l'amminoacido TOAC: sintesi e caratterizzazione conformazionale

Il lavoro di questa tesi si inserisce all’interno di un progetto di ricerca inerente la sintesi di peptidi modello del complesso proteico SNARE coinvolto nei processi di trasporto vescicolare con la funzione di mediare l’aggancio della vescicola con la membrana bersaglio. L’interazione tra la componente proteica presente sulla vescicola e quella presente sulla membrana cellulare avviene tramite la formazione di strutture coiled-coil rendendo le sequenze coinvolte ottimi modelli per lo studio di queste interazioni. L’introduzione nella sequenza peptidica di un residuo amminoacidico contenente un gruppo radicalico in catena laterale, il TOAC, permette di utilizzare la spettroscopia EPR nello studio di queste interazioni. La presenza di una sonda radicalica e la sua conservazione lungo il processo di sintesi e la successiva purificazione ha presentato non pochi problemi riducendo notevolmente le rese di sintesi. Oltre ai peptidi contenenti uno o due residui di TOAC è stato sintetizzato anche il peptide K-Y18 che presenta un residuo di Tyr in posizione 18 che verrà utilizzato in successivi studi di fluorescenza. La struttura secondaria dei peptidi sintetizzati è stata studiata mediante misure di dicroismo circolare in ambiente acquoso e membrano mimetico.