Analisi epitrascrittomica rivela firme cliniche e molecolari nel glioblastoma

Il glioblastoma (GB) è il più frequente tumore maligno primario del sistema nervoso centrale nell'adulto. Un rilevante dilemma clinico è la difficoltà nel distinguere la vera progressione tumorale (progressive disease, PD) dalla pseudo-progressione (pseudo-progressive disease, psPD), due condizioni che richiedono approcci terapeutici opposti. Questo studio mira a caratterizzare il GB dal punto di vista epitrascrittomico per identificare firme molecolari differenzialmente rappresentate tra pazienti che svilupperanno PD o psPD, rilevabili già dalla prima biopsia. A tal fine, gli autori hanno analizzato i pattern di metilazione dell'RNA N6-metiladenosina (m6A) nei due gruppi di pazienti. L'analisi è stata condotta su campioni di 92 pazienti con GB. Dopo estrazione dell'RNA e normalizzazione dei dati, sono stati identificati i trascritti differenzialmente metilati (mediante digestione con MazF e analisi microarray) e i geni differenzialmente espressi tra PD e psPD. Le successive analisi di arricchimento (tramite GO e KEGG) e di co-espressione (tramite WGCNA) hanno identificato geni e pathway il cui stato di metilazione modificato tra i due gruppi è associato ad alterazioni del metabolismo cellulare, della regolazione dell'espressione genica e della segnalazione cellulare. Questi risultati aprono nuove prospettive per comprendere i meccanismi epitrascrittomici che distinguono PD da psPD e per lo sviluppo di potenziali biomarcatori predittivi.