Performance di un nuovo test molecolare rapido per la rilevazione di Mycobacterium tuberculosis complex e micobatteri non tubercolari (NTM): confronto con altri test utilizzati nella pratica clinica

Introduction: Tuberculosis is the leading cause of death from a single infectious agent, while infec-tions caused by nontuberculous mycobacteria (NTM) are increasing, making rapid and accurate dia-gnosis essential. This study evaluated the performance of the Mycobacteriaceae Identification Test Kit on the iFIND® S2 system (RocGene), a Real-Time PCR assay that detects Mycobacteriaceae and M. tuberculosis complex (MTBC) and identifies seven NTM species by melting curve analysis, compa-red with Xpert® MTB/RIF Ultra and with culture followed by GenoType® Mycobacterium CM identification on GT-Blot 48. Materials and Methods: At the Microbiology Unit of San Bortolo Hospital, Vicenza (April–September 2026), 35 cartridges were used on 19 residual clinical samples and 9 stored isolates. The qualitative analysis included 29 tests (MTBC group: 7; NTM group: 22), the quantitative analysis five ten-fold serial dilutions of an MTBC isolate. Agreement was expressed with 95% confidence inter-vals. Results: Valid results were obtained in 33 of 35 tests. MTBC was detected in 7/7 samples, including two smear-negative samples, with no false positives (21/21). The NTM species was correctly identi-fied in 4/6 clinical samples, including all three smear-positive, Xpert®-negative samples, in which iFIND provided the species in about 3 hours compared with a routine turnaround time of 27–54 days, and in 8/10 tests on isolates, with a reproducible M. chelonae/M. abscessus discordance. The standard curves showed good linearity (R² = 0.9867 in the Mycobacteriaceae channel; 0.9904 in the MTB channel). Discussion: The assay showed good agreement with current methods and appears promising for rapid NTM identification directly from clinical samples. As it provides no information on viability or drug resistance, it cannot replace culture or Xpert® MTB/RIF Ultra, but it could be integrated into the dia-gnostic workflow.

Introduzione: La tubercolosi è la principale causa di morte dovuta a un singolo agente infettivo, men-tre le infezioni da micobatteri non tubercolari (NTM) sono in aumento: una diagnosi rapida e accurata è quindi essenziale. Lo studio ha valutato le prestazioni del Mycobacteriaceae Identification Test Kit su sistema iFIND® S2 (RocGene), test Real-Time PCR che rileva Mycobacteriaceae e M. tuberculo-sis complex (MTBC) e identifica sette specie di NTM mediante analisi delle curve di melting, con-frontandolo con Xpert® MTB/RIF Ultra e con l’esame colturale seguito da identificazione con Geno-Type® Mycobacterium CM su GT-Blot 48. Materiali e Metodi: Presso l’UOC di Microbiologia dell’Ospedale San Bortolo di Vicenza (aprile-settembre 2026) sono state impiegate 35 cartucce su 19 campioni clinici residui e 9 isolati da ceppote-ca. L’analisi qualitativa ha compreso 29 test (gruppo MTBC: 7; gruppo NTM: 22), l’analisi quantitati-va cinque diluizioni seriali decimali di un isolato di MTBC. Le concordanze sono state espresse con intervalli di confidenza al 95%. Risultati: I test validi sono stati 33 su 35. MTBC è stato rilevato in 7/7 campioni, compresi due con esame microscopico negativo, senza falsi positivi (21/21). La specie di NTM è stata identificata corret-tamente in 4/6 campioni clinici di cui 3/3 con esame microscopico positivo e Xpert® negativo. In 8/10 test iFIND ha fornito la specie in circa 3 ore a fronte di un tempo di refertazione di routine di 27-54 giorni con una discordanza riproducibile M. chelonae/M. abscessus. Le curve standard hanno mostrato una buona linearità (R² = 0,9867 nel canale Mycobacteriaceae; 0,9904 nel canale MTB). Discussione e Conclusioni: Il test ha mostrato una buona concordanza con le metodiche in uso ed è promettente per l’identificazione rapida degli NTM direttamente dal campione clinico. Non fornendo informazioni su vitalità e farmacoresistenza, non si propone di sostituire l’esame colturale né Xpert® MTB/RIF Ultra, ma potrebbe integrarsi nell’iter diagnostico.