Turnover delle proteine

Lo scopo della tesi è descrivere l'analisi del turnover delle proteine integrando le informazioni dei livelli di espressione genica e proteica con informazioni relative al loro comportamento dinamico. Verranno esaminati alcuni modelli semplici per descrivere la dinamica e i tempi di risposta di alcuni motivi-base di regolazione tra geni e proteine. Si inizia con l’analisi del turnover delle singole proteine integrando le informazioni dei livelli di espressione genica e proteica con informazioni sul loro comportamento dinamico. Si evidenzierà inoltre come la concentrazione di una proteina nel plasma è funzione dalla sua velocità di produzione e dalla sua velocità di degradazione. Infine, concluderemo con un analisi teorica delle proprietà di alcuni pattern ricorrenti come ad esempio i motivi di autoregolazione negativa, positiva o il feed-forward descrivendo le loro caratteristiche all’interno di una rete reale