Frustrazione residua in strutture di proteine topologicamente complesse

La presente tesi ha come obiettivo principale lo studio della relazione tra frustrazione e complessità topologica all’interno delle proteine. Partendo dalla struttura proteica, si parlerà del problema ancora aperto del folding delle proteine, evidenziando il ruolo chiave della frustrazione. Si discuterà poi delle principali complessità topologiche presenti all’interno delle proteine, come nodi e loop, e della loro struttura. Si andranno infine ad analizzare i risultati computazionali riguardanti la frustrazione. L’analisi del rapporto tra frustrazione e complessità topologica porterà a risultati interessanti sia nell’andamento globale della frustrazione, sia nell’andamento particolare di ciascuna proteina.