La tesi tratta l'interazione fra canali calcio dipendenti dal voltaggio (CaV) e canali potassio large-conductance (BK) dipendenti dalla concentrazione citosolica di ioni Ca^2+, tenendo in considerazione il moto Browniano dei canali calcio sulla membrana cellulare. La depolarizzazione della membrana provoca l'attivazione dei canali calcio, che permette l'ingresso di ioni Ca^2+ nella cellula. Questo aumento della concentrazione di Ca^2+ tende ad attivare il canale BK in base alla distanza a cui si trova rispetto ai canali calcio aperti. L'obiettivo del lavoro è studiare come la diffusione dei canali calcio influenza la possibilità che si formi il complesso BK_Ca-CaV e di conseguenza la probabilità di apertura del canale BK. A questo scopo due approcci sono utilizzati: una simulazione Monte Carlo di random walk in due dimensioni, che fornisce informazioni sul ruolo del complesso nella dinamica di apertura del BK, e un modello su griglia per il quale è possibile definire una catena di Markov a tempo continuo, che costituisce una buona approssimazione della diffusione Browniana ed inoltre richiede minore costo computazionale.

Modeling how CaV channel diffusion in the cell membrane affects formation of the BK_Ca-Cav channel complex

Martini, Eleonora
2019/2020

Abstract

La tesi tratta l'interazione fra canali calcio dipendenti dal voltaggio (CaV) e canali potassio large-conductance (BK) dipendenti dalla concentrazione citosolica di ioni Ca^2+, tenendo in considerazione il moto Browniano dei canali calcio sulla membrana cellulare. La depolarizzazione della membrana provoca l'attivazione dei canali calcio, che permette l'ingresso di ioni Ca^2+ nella cellula. Questo aumento della concentrazione di Ca^2+ tende ad attivare il canale BK in base alla distanza a cui si trova rispetto ai canali calcio aperti. L'obiettivo del lavoro è studiare come la diffusione dei canali calcio influenza la possibilità che si formi il complesso BK_Ca-CaV e di conseguenza la probabilità di apertura del canale BK. A questo scopo due approcci sono utilizzati: una simulazione Monte Carlo di random walk in due dimensioni, che fornisce informazioni sul ruolo del complesso nella dinamica di apertura del BK, e un modello su griglia per il quale è possibile definire una catena di Markov a tempo continuo, che costituisce una buona approssimazione della diffusione Browniana ed inoltre richiede minore costo computazionale.
2019-12-09
47
ion channels, brownian motion, markov chain
File in questo prodotto:
File Dimensione Formato  
Tesi_LM_F_Martini_Eleonora.pdf

accesso aperto

Dimensione 1.87 MB
Formato Adobe PDF
1.87 MB Adobe PDF Visualizza/Apri

The text of this website © Università degli studi di Padova. Full Text are published under a non-exclusive license. Metadata are under a CC0 License

Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/22614