Analisi statistica delle proprietà di complessità topologica in strutture di proteine

La tesi ha come obiettivo l'analisi delle complessità topologiche nelle strutture di proteine alla luce dell'ipotesi di Anfinsen. Secondo tale ipotesi, infatti, le proteine, una volta "assemblate" nel ribosoma, ripiegano sempre nello stesso modo. Questo perchè alla configurazione finale deve corrispondere un minimo dell'energia libera. E'infatti peculiare che, nonostante i molteplici e possibili legami che si posso instaurare tra amminoacidi (della stessa catena peptidica), la proteina venga a trovarsi sempre nella stessa struttura tridimensionale. Struttura tridimensionale a volte anche molto complessa. Per far questo si è usato, prima di tutto, un indicatore, chiamato "Gaussian entanglement", che esprime quanto un loop e un filamento della stessa proteina siano "attorcigliati". Poi si sono analizzati vari segnali statistici: uno di questi è la tendenza del loop a farsi intersecare dal filamento N-thread o C-thread ovvero quei filamenti che rispetto al loop stesso si trovano più vicino all' N-terminale che al C-terminale della stessa proteina. Si è anche fatta un'analisi, con relativi grafici, usando anche gli N-thread e C-thread in funzione della lunghezza del loop.