Identificazione di peptidi segnale per l'esportazione di proteine cellulari in Nannochloropsis oceanica

Nannochloropsis oceanica è una microalga utilizzata sia a livello di ricerca che a livello industriale per le sue ottime capacità produttive e le sue scarse necessità di coltura. In questo studio ci si è focalizzati sul ricercare dei peptidi segnale (SP) in grado di indurre la secrezione di proteine. La ricerca di peptidi segnale esportatori è utile perché questi permettono di utilizzare le microalghe per la produzione a livello industriale di proteine di interesse per varie applicazioni. I SP sono delle piccole porzioni di proteina che hanno lo scopo di identificare la localizzazione del peptide a cui sono legati. La presenza di peptidi segnale in grado di permettere l'esportazione di proteine all'esterno della cellula non è ancora stata provata in questo organismo. Proprio per questo motivo, tramite un'analisi bioinformatica, sono stati selezionati dei SP per l'esportazione in organismi filogeneticamente vicini da cui sono stati poi individuati gli omologhi in N.oceanica. Sono stati scelti i 5 candidati più promettenti e la loro capacità di fungere da segnale è stata esaminata tramite una proteina fluorescente, YFP, a cui è stato legato il possibile peptide segnale.