Analisi delle popolazioni cellulari immunitarie polmonari in pazienti COVID-19 con approcci omici a singola cellula

Il presente elaborato riguarda l’analisi critica di un articolo su un esperimento allestito nel primo periodo della pandemia di COVID-19. L’obiettivo principale del lavoro era l’esame e la valutazione delle popolazioni cellulari immunitarie presenti nel fluido broncoalveolare (BALF) estratto da pazienti affetti con diversa gravità da COVID-19. I ricercatori hanno dunque predisposto un esperimento di Single cell RNA sequencing (scRNAseq) sul BALF col quale si sono potute profilare le popolazioni cellulari presenti e valutare le differenze di espressione genica tra i diversi cluster cellulari. I dati sono stati ampliati con un esperimento di Single cell TCR sequencing (scTCR-seq), tecnica utile a valutare il grado di espansione clonale dei linfociti T nei diversi campioni. Infine l’esperimento si è concluso con la misura dei livelli di citochine presenti nel BALF. I risultati ottenuti e combinati suggeriscono un forte scompenso di macrofagi e linfociti T tra chi sviluppa la malattia grave e chi moderata. Inoltre sembra che gli stessi macrofagi possano svolgere un ruolo differente in base alla gravità della malattia stessa, coadiuvando la guarigione, o alimentandone l’anomalo processo infiammatorio alla base della patologia. In questa analisi critica dell’articolo verranno esaminati i metodi, i protocolli e i risultati ottenuti, comparandoli con altre tecniche ed esperimenti affini.