In questa tesi sono state condotte delle simulazioni di dinamica molecolare classica che hanno permesso di studiare l'evoluzione conformazionale di un peptide in soluzione in presenza di ioni Mg2+. Dal confronto con simulazioni svolte in precedenza dal gruppo è stato possibile ricavare informazioni sul ruolo dell'identità dello ione nella dinamica del sistema, ottenendo risultati coerenti con quelli delle altri simulazioni e promettenti per l'applicazione di sequenziamento di proteine tramite traslocazione attraverso un nano-poro metallico e misure di spettroscopia Raman.
Simulazione di dinamica molecolare per la traslocazione di peptidi attraverso nanopori
ULLIANA, ANNA
2022/2023
Abstract
In questa tesi sono state condotte delle simulazioni di dinamica molecolare classica che hanno permesso di studiare l'evoluzione conformazionale di un peptide in soluzione in presenza di ioni Mg2+. Dal confronto con simulazioni svolte in precedenza dal gruppo è stato possibile ricavare informazioni sul ruolo dell'identità dello ione nella dinamica del sistema, ottenendo risultati coerenti con quelli delle altri simulazioni e promettenti per l'applicazione di sequenziamento di proteine tramite traslocazione attraverso un nano-poro metallico e misure di spettroscopia Raman.File in questo prodotto:
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https://hdl.handle.net/20.500.12608/48315