Questa tesi studia un interessante problema legato al mondo della biologia. Il problema del Minimal Seed Set e' cosi' definito: data una descrizione delle molecole che compongono un organismo e delle reazioni chimiche che possono avvenire al suo interno, determinare il piu' piccolo sottoinsieme di molecole che, attraverso le reazioni, possa essere combinato fino a raggiungere l'intero insieme. Viene mostrato come una formulazione MIP del problema non solo e' possibile, ma scala bene anche per i sistemi piu' complessi e permette di risolvere tutte le istanze prese in esame in tempi brevi. Saranno presentate due possibili formulazioni per il problema e ne verranno confrontati i risultati.

Un approccio MIP per la risoluzione del problema del Minimal Seed Set

BASAGLIA, ALBERTO
2022/2023

Abstract

Questa tesi studia un interessante problema legato al mondo della biologia. Il problema del Minimal Seed Set e' cosi' definito: data una descrizione delle molecole che compongono un organismo e delle reazioni chimiche che possono avvenire al suo interno, determinare il piu' piccolo sottoinsieme di molecole che, attraverso le reazioni, possa essere combinato fino a raggiungere l'intero insieme. Viene mostrato come una formulazione MIP del problema non solo e' possibile, ma scala bene anche per i sistemi piu' complessi e permette di risolvere tutte le istanze prese in esame in tempi brevi. Saranno presentate due possibili formulazioni per il problema e ne verranno confrontati i risultati.
2022
A MIP approach to the Minimal Seed Set problem
modelli
mip
cplex
rust
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/48603