Synthetic biology in ESKAPE bacteria

La resistenza antibiotica (AMR) è considerata dall’Organizzazione Mondiale della Sanità come una delle dieci principali minacce per la salute pubblica a livello mondiale. L’OMS conta più di 700 mila morti all’anno e stima che entro il 2050 questo numero supererà i 10 milioni. L’antibiotico resistenza è da attribuirsi ad un gruppo di microrganismi patogeni riassunti sotto la sigla ESKAPE (E.faecium, S.aureus, K.pneumoniae, A. spp., P.aeruginosa, E.coli). In questo quadro, emerge l’importanza della ricerca di nuove strategie terapeutiche da impiegare in alternativa o in supporto all’uso degli antibiotici. Questo progetto di tesi, nell’ambito del progetto PASTA (Phage Assisted Silencing Tool against Antibiotic resistant), si propone lo sviluppo di un approccio basato sulla specificità dei batteriofagi come piattaforma di delivery e sulla tecnologia di CRISPR interference al fine di silenziare geni batterici implicati nell’antibiotico resistenza e sviluppare una nuova strategia terapeutica da affiancare al comune utilizzo degli antibiotici per ottenere un effetto sinergico degli stessi. In particolare l’elaborato si focalizza sulla trasformazione del batterio K.pneumoniae al fine di trasferire il plasmide contenente il gene che trascrive la dCAS9 e la guida, implicata nel riconoscimento della sequenza target coinvolta nell’antibiotico resistenza.