Validazione di saggi in PCR quantitativa per l’identificazione dei trascritti di fusione SYT-SSX1 e SYT-SSX2 del Sarcoma Sinoviale pediatrico

Synovial sarcoma (SS) is a soft tissue sarcoma (STS) with a high incidence in young adults. At a genetic level, it is characterized by a specific chromosomal translocation t(X;18)(p11.2;q11.2) which gives rise to a fusion transcript, SYT-SSX, which codes for an oncogenic protein which promotes growth and cell proliferation. There are three forms of fusion transcripts associated with SS: SYT-SSX1, SYT-SSX2, or SYT-SSX4 (very rare). The fusion transcripts differ for the homologous gene at the 3' position (SSXn). The identification of the presence of the SYT-SSX1/2 fusion transcript in a biopsy specimen from a patient with a suspected diagnosis of SS is a routine diagnostic procedure. In this work we verified the specificity and efficiency of two assays for the detection of SYT-SSX1 and SYT-SSX2 fusion transcripts in quantitative PCR, both by SYBR Green technique and by the use of TaqMan probes. The SYT-SSX1 detection assay showed an efficiency of 89.38% - R2=0.98 while the SYT-SSX2 detection assay showed an efficiency of 104.15% - R2=0.98 , therefore they can be used in molecular diagnostics.

Il Sarcoma Sinoviale (SS) è un sarcoma dei tessuti molli (STM) ad elevata incidenza nei giovani adulti. A livello genetico è caratterizzato da una specifica traslocazione cromosomica t(X;18)(p11.2;q11.2) che dà origine ad un trascritto di fusione, SYT-SSX, che codifica per una proteina oncogenica che promuove la crescita e la proliferazione cellulare. Esistono tre forme di trascritti di fusione associate al SS: SYT-SSX1, SYT-SSX2 o SYT-SSX4 (rarissimo). I trascritti di fusione differiscono per il gene omologo in posizione 3’ (SSXn). L’identificazione della presenza del trascritto di fusione SYT-SSX1/2 in un campione bioptico di un paziente con sospetta diagnosi di SS è una pratica di routine nell’iter diagnostico. In questo lavoro si è verificata la specificità e l’efficienza di due saggi per la rilevazione dei trascritti di fusione SYT-SSX1 e SYT-SSX2 in PCR quantitativa, sia mediante tecnica SYBR Green e sia mediante l’utilizzo di sonde TaqMan. Il saggio per la rilevazione di SYT-SSX1 ha mostrato un’efficienza dell’89,38% - R2=0,98 mentre il saggio per la rilevazione di SYT-SSX2 un’efficienza del 104,15% - R2=0,98, pertanto possono essere utilizzati in diagnostica molecolare.