L’oggetto di questo elaborato sperimentale è parte di un più ampio progetto dell’Orto Botanico dell’Università degli Studi di Padova il cui scopo ultimo è l‘identificazione e la classificazione delle piante ad oggi presenti al suo interno mediante la tecnica del DNA barcoding. Tale metodica, oltre ad essere essenziale per quanto riguarda studi tassonomici, si rivela cruciale anche in ambito industriale, dove può essere utilizzata come strumento di controllo dell’intera filiera produttiva. Applicare il DNA barcoding come strumento di verifica della qualità in ambito produttivo potrebbe rappresentare in futuro un’evoluzione positiva degli standard di sicurezza e autenticità, soprattutto nel settore plant-based. In particolare, questa tesi si concentra su tre specie vegetali, ovvero Magnolia grandiflora (Mg), Pistacia terebinthus (Pt), Coffea arabica (Ca) ed è dedicata all’identificazione di un protocollo di estrazione efficiente del materiale genetico che possa essere replicato a livello didattico su più specie, anche molto diverse tra di loro. Inoltre la tesi tratta le fasi successive all’estrazione genomica, ovvero amplificazione, sequenziamento e analisi bioinformatica delle sequenze target mediante i barcodes selezionati.

Identificazione di un protocollo sperimentale per il DNA barcoding di piante dell’Orto Botanico di Padova applicabile in contesti didattici

VACCARI, PAOLO
2022/2023

Abstract

L’oggetto di questo elaborato sperimentale è parte di un più ampio progetto dell’Orto Botanico dell’Università degli Studi di Padova il cui scopo ultimo è l‘identificazione e la classificazione delle piante ad oggi presenti al suo interno mediante la tecnica del DNA barcoding. Tale metodica, oltre ad essere essenziale per quanto riguarda studi tassonomici, si rivela cruciale anche in ambito industriale, dove può essere utilizzata come strumento di controllo dell’intera filiera produttiva. Applicare il DNA barcoding come strumento di verifica della qualità in ambito produttivo potrebbe rappresentare in futuro un’evoluzione positiva degli standard di sicurezza e autenticità, soprattutto nel settore plant-based. In particolare, questa tesi si concentra su tre specie vegetali, ovvero Magnolia grandiflora (Mg), Pistacia terebinthus (Pt), Coffea arabica (Ca) ed è dedicata all’identificazione di un protocollo di estrazione efficiente del materiale genetico che possa essere replicato a livello didattico su più specie, anche molto diverse tra di loro. Inoltre la tesi tratta le fasi successive all’estrazione genomica, ovvero amplificazione, sequenziamento e analisi bioinformatica delle sequenze target mediante i barcodes selezionati.
2022
Identification of an experimental protocol for the DNA barcoding of plants from the Padua Botanical Garden applicable in educational contexts
DNA barcoding
Magnolia grandiflora
Pistacia terebinthus
Coffea arabica
Orto botanico
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/52009