Introduzione: Le miopatie infiammatorie idiopatiche (MII) sono un gruppo eterogeneo di malattie rare immuno-mediate i cui meccanismi non sono ancora stati chiariti e per le quali sono ancora carenti biomarcatori per la diagnosi precoce. Le vescicole extracellulari (EVs) sono nanoparticelle implicate nel signaling intercellulare in grado di trasportare microRNA (miRNA), RNA e proteine. I miRNA sono brevi sequenze di RNA non codificante che regolano l’espressione genica post-trascrizionale. Recenti evidenze mettono in luce il loro ruolo nella fisiopatologia delle malattie autoimmuni. Comunque, il ruolo dei miRNA contenute nelle EVs-miRNA nei pazienti affetti da MII non è stato esaustivamente esplorato. Scopo dello studio: Lo scopo dello studio è di caratterizzare nei pazienti affetti da MII le EVs plasmatiche, e di determinare, mediante tecnologia NGS, il profilo di espressione dei miRNA nelle EVs. Ci proponiamo inoltre di indagare l’effetto del trattamento farmacologico con glucocorticoidi o glucocorticoidi e immunosoppressori sulla concentrazione delle EVs circolanti e sulla espressione dei miRNA nei pazienti affetti da MII. Pazienti e Metodi: In questo studio sono stati reclutati 47 pazienti adulti (≥ 18 anni) affetti da MII in follow-up presso l'U.O.C. di Reumatologia dell'Azienda Ospedaliera di Padova e 45 donatori sani (HD) appaiati per età e sesso. Si è ottenuto l’isolamento delle EVs tramite cromatografia ad esclusione dimensionale seguita da ultrafiltrazione. Concentrazione e dimensioni delle EVs sono state valutate tramite Nanoparticle tracking analysis (“Analisi del Tracciamento delle Nanoparticelle”, NTA). La caratterizzazione del cargo dei miRNA delle EVs è stata realizzata mediante QIAseq miRNA Library Kit, le librerie sono state in seguito sequenziate mediante piattaforma Illumina NextSeq 550. L’analisi bioinformatica dell’espressione dei miRNA è stata eseguita mediante il software CLC Genomics Workbench. Risultati: L’analisi dei miRNA presenti nelle EVs ha evidenziato un profilo di espressione significativamente diverso tra i due gruppi. Quattro miRNA (miR-122-5p, miR-486-5p, miR-192-5p e miR-32-5p) sono risultati essere significativamente aumentati nelle EVs ottenuti dai pazienti con MII rispetto al gruppo di controllo, mentre quattro miRNA (miR-142-3p, miR-141-3p, Let-7a-5p e miR-3613-5p) sono risultati essere significativamente ridotti. I migliori valori di performance della curva ROC sono stati ottenuti per miR-486-5p (AUC =0.74) e per miR-142-3p (AUC=0.79). La concentrazione delle EVs circolanti è risultata significativamente aumentata nel gruppo di pazienti affetti da MII associato alle neoplasie (cancer-associated myosytes, CAM) rispetto a quello senza neoplasie. Inoltre, l’analisi differenziale dei miRNA ha mostrato che il let-7f-5p è significativamente aumentato nei pazienti con CAM (p=0.001), mentre il miR-143-3p è significativamente ridotto rispetto ai pazienti MII senza CAM (p=0.002). Nei pazienti affetti da MII, la somministrazione farmacologica con glucocorticoidi e immunosoppressori ha ridotto la concentrazione delle EVs circolanti rispetto alla sola somministrazione con glucocorticoidi . Inoltre, l’associazione glucocorticoidi e immunosoppressori ha ridotto l ’espressione di let-7f-5p (p=0.03), di miR-4433b-5p (p=0.04) e di miR-92a-3p (p=0.01) e ha aumentato l’espressione di miR-27a-3p (p=0.03) rispetto al trattamento con solo glucocorticoidi. Conclusione: Questo studio ha dimostrato il ruolo delle EVs circolanti come potenziali marcatori di MII e ha evidenziato come i miRNA presenti nelle EVs possono svolgere un ruolo importante come mediatori cellulari tra il sistema immunitario e il tessuto muscolare. Inoltre, la modulazione dell’espressione dei miRNA nelle EVs indotta dal trattamento farmacologico può fornire utili informazioni per lo sviluppo di efficaci terapie nelle MII.

Studio dei microRNA circolanti in vescicole extracellulari nelle miopatie infiammatorie idiopatiche ed effetto della terapia con glucocorticoidi e immunosoppressori

BEVILACQUA, GIOELE
2022/2023

Abstract

Introduzione: Le miopatie infiammatorie idiopatiche (MII) sono un gruppo eterogeneo di malattie rare immuno-mediate i cui meccanismi non sono ancora stati chiariti e per le quali sono ancora carenti biomarcatori per la diagnosi precoce. Le vescicole extracellulari (EVs) sono nanoparticelle implicate nel signaling intercellulare in grado di trasportare microRNA (miRNA), RNA e proteine. I miRNA sono brevi sequenze di RNA non codificante che regolano l’espressione genica post-trascrizionale. Recenti evidenze mettono in luce il loro ruolo nella fisiopatologia delle malattie autoimmuni. Comunque, il ruolo dei miRNA contenute nelle EVs-miRNA nei pazienti affetti da MII non è stato esaustivamente esplorato. Scopo dello studio: Lo scopo dello studio è di caratterizzare nei pazienti affetti da MII le EVs plasmatiche, e di determinare, mediante tecnologia NGS, il profilo di espressione dei miRNA nelle EVs. Ci proponiamo inoltre di indagare l’effetto del trattamento farmacologico con glucocorticoidi o glucocorticoidi e immunosoppressori sulla concentrazione delle EVs circolanti e sulla espressione dei miRNA nei pazienti affetti da MII. Pazienti e Metodi: In questo studio sono stati reclutati 47 pazienti adulti (≥ 18 anni) affetti da MII in follow-up presso l'U.O.C. di Reumatologia dell'Azienda Ospedaliera di Padova e 45 donatori sani (HD) appaiati per età e sesso. Si è ottenuto l’isolamento delle EVs tramite cromatografia ad esclusione dimensionale seguita da ultrafiltrazione. Concentrazione e dimensioni delle EVs sono state valutate tramite Nanoparticle tracking analysis (“Analisi del Tracciamento delle Nanoparticelle”, NTA). La caratterizzazione del cargo dei miRNA delle EVs è stata realizzata mediante QIAseq miRNA Library Kit, le librerie sono state in seguito sequenziate mediante piattaforma Illumina NextSeq 550. L’analisi bioinformatica dell’espressione dei miRNA è stata eseguita mediante il software CLC Genomics Workbench. Risultati: L’analisi dei miRNA presenti nelle EVs ha evidenziato un profilo di espressione significativamente diverso tra i due gruppi. Quattro miRNA (miR-122-5p, miR-486-5p, miR-192-5p e miR-32-5p) sono risultati essere significativamente aumentati nelle EVs ottenuti dai pazienti con MII rispetto al gruppo di controllo, mentre quattro miRNA (miR-142-3p, miR-141-3p, Let-7a-5p e miR-3613-5p) sono risultati essere significativamente ridotti. I migliori valori di performance della curva ROC sono stati ottenuti per miR-486-5p (AUC =0.74) e per miR-142-3p (AUC=0.79). La concentrazione delle EVs circolanti è risultata significativamente aumentata nel gruppo di pazienti affetti da MII associato alle neoplasie (cancer-associated myosytes, CAM) rispetto a quello senza neoplasie. Inoltre, l’analisi differenziale dei miRNA ha mostrato che il let-7f-5p è significativamente aumentato nei pazienti con CAM (p=0.001), mentre il miR-143-3p è significativamente ridotto rispetto ai pazienti MII senza CAM (p=0.002). Nei pazienti affetti da MII, la somministrazione farmacologica con glucocorticoidi e immunosoppressori ha ridotto la concentrazione delle EVs circolanti rispetto alla sola somministrazione con glucocorticoidi . Inoltre, l’associazione glucocorticoidi e immunosoppressori ha ridotto l ’espressione di let-7f-5p (p=0.03), di miR-4433b-5p (p=0.04) e di miR-92a-3p (p=0.01) e ha aumentato l’espressione di miR-27a-3p (p=0.03) rispetto al trattamento con solo glucocorticoidi. Conclusione: Questo studio ha dimostrato il ruolo delle EVs circolanti come potenziali marcatori di MII e ha evidenziato come i miRNA presenti nelle EVs possono svolgere un ruolo importante come mediatori cellulari tra il sistema immunitario e il tessuto muscolare. Inoltre, la modulazione dell’espressione dei miRNA nelle EVs indotta dal trattamento farmacologico può fornire utili informazioni per lo sviluppo di efficaci terapie nelle MII.
2022
Analysis of circulating microRNAs in extracellular vesicles in idiopathic inflammatory myopathies and effect of glucocorticoids and immunosuppressants
miopatie idiopatiche
microRNA
glucocorticoidi
immunosoppressori
NGS
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/55946