L’archetypal analysis (AA) è un metodo statistico che permette di analizzare grandi data set estraendo da essi degli archetipi. Viene utilizzata in molti ambiti, tra cui quello della bioinformatica, principalmente per semplificare l’analisi di dati omici e multi-omici. L’elaborato studia a tutto tondo l’AA, presentando prima la teoria alla sua base e le sue caratteristiche principali e ponendola a confronto con altri metodi di clustering. Passando poi ad alcune sue ottimizzazioni ed estensioni, che presentano meno limitazioni rispetto al modello originale, e all’analisi di diversi software e pacchetti per l’utilizzo dell’AA. Infine, verranno illustrati diversi esempi di applicazioni dell’AA al campo della bioinformatica per l’analisi di dati omici.
Archetypal Analysis e sue applicazione nel campo della bioinformatica
PASQUETTO, AURORA
2022/2023
Abstract
L’archetypal analysis (AA) è un metodo statistico che permette di analizzare grandi data set estraendo da essi degli archetipi. Viene utilizzata in molti ambiti, tra cui quello della bioinformatica, principalmente per semplificare l’analisi di dati omici e multi-omici. L’elaborato studia a tutto tondo l’AA, presentando prima la teoria alla sua base e le sue caratteristiche principali e ponendola a confronto con altri metodi di clustering. Passando poi ad alcune sue ottimizzazioni ed estensioni, che presentano meno limitazioni rispetto al modello originale, e all’analisi di diversi software e pacchetti per l’utilizzo dell’AA. Infine, verranno illustrati diversi esempi di applicazioni dell’AA al campo della bioinformatica per l’analisi di dati omici.File | Dimensione | Formato | |
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https://hdl.handle.net/20.500.12608/57097