From March 2021 to June 2023, 402 patients were discussed at the multidisciplinary board for inherited gastrointestinal tumours of Padua Health District. Retrospectively, indications for discussion were categorized into the following: personal cancer history, early age at onset of cancer, familial cancer history, cancer histotypes, results of somatic genomic analysis, polyposis and management of patients with known inherited tumour syndrome. The recommendations to germline genetic testing were analysed in relation to the indications for discussion, and the mutation detection rate (MDR) was investigated. The results of germline genetic testing were analysed in relation to the indication for discussion. Every patient was presented using the AOUPD-IOV IT platform health-meeting by the care provider, the discussion took place online using the same platform. The study analysed 402 patients, 87 (21%) of them were young (<50-year-old) at the time of the multidisciplinary discussion, 65 (16%) were already diagnosed a genetic cancer syndrome, 363 (90%) had a personal history of cancer. The most frequent indication for the discussion was the family history of cancer (n=155, 27%), followed by result of somatic genomic analysis (n=91, 15%), which was a new prevalent indication for genetic cancer syndrome discussion. 193 (48%) patients received an indication for a germinal genetic testing, but just 153 (79%) of them underwent it. A GPV was diagnosed in 28 patients, making the overall MDR 18%. The indication for the germinal genetic testing with the highest MDR was the result of somatic genomic analysis (23%; p=0.02). The GPVs were found in the MMR genes, MUTYH, BRCA1/BRCA2 and other genes (APC, CDKN2A, MEN1, ATM), in 10, 8, 6 and 5 cases, respectively (one patient was diagnosed with 2 GPVs). In the group of patients with BRCA1/2 GPVs nobody had a personal history of breast or ovarian cancer and just one patient was diagnosed with pancreatic cancer. Patients with MUTYH GPVs were diagnosed mostly with colorectal cancer (n=5), but a pancreatic NET, a melanoma and a gastric cancer were found too. It was analysed the group of young patients (<50-year-old) with stable CRC (n=23) and 4 of them (17%) were diagnosed with a GPV (2 MUTYH, APC, BRCA2). The multidisciplinary board for inherited gastrointestinal tumours contributes selecting patients who should undergo germinal genetic testing. The results show a strong overlap between genotype and phenotype, making obsolete the current denomination of some hereditary cancer syndromes. At this point new indications to the germinal test are common and characterized by an elevated MDR, such as the result of somatic genomic analysis.

FI pazienti discussi al gruppo oncologico multidisciplinare dei tumori ereditari gastrointestinali (GOM TEGI) dell’Azienda Ospedaliera Università di Padova - Istituto Oncologico Veneto da marzo 2021 a giugno 2023, sono stati inclusi in questo studio retrospettivo. Al GOM TEGI hanno discusso casi professionisti sanitari da tutta la Regione Veneto e da due Unità della Regione Lombardia. Le indicazioni alla discussione sono state categorizzate in: storia oncologica personale, tumore giovanile, storia oncologica familiare, istotipo tumorale, risultato del sequenziamento genetico somatico, poliposi e management di pazienti con sindrome eredo-familiare nota. Le raccomandazioni al test genetico germinale sono state analizzate in relazione alle indicazioni alla discussione. I risultati del test genetico germinale sono stati analizzati in relazione alle indicazioni al test ed è stata calcolata la mutation detection rate (MDR) delle diverse indicazioni al test genetico. Ogni paziente è stato presentando dal care-provider utilizzato la piattaforma online condivisa tra AOUPD e IOV health-meeting®; la discussione è avvenuta usando la stessa piattaforma virtuale. Sono stati arruolati allo studio 402 pazienti, 87 (21%) di questi erano giovani (<50 anni) al momento della discussione; solo 65 (16%) avevano già ricevuto diagnosi di sindrome ereditaria, 363 (90%) aveva una storia personale di tumore. L’indicazione più frequente alla discussione multidisciplinare è stata la storia familiare oncologica (n=155, 27%), seguita dal risultato del sequenziamento somatico (n=91, 15%), Centonovantatre (48%) pazienti hanno ricevuto indicazione al test genetico germinale, ma solo 153 (79%) l’hanno eseguito. Varianti genetiche patogenetiche germinali (GPVs) sono state riscontrate in 28 pazienti, dimostrando una MDR generale del 18%. L’indicazione al test genetico germinale con la maggiore MDR è stata il risultato del sequenziamento somatico (23%, p=0.02). Sono state riscontrate GPVs ai danni dei geni MMR, MUTYH, BRCA1/2 e altri (APC, CDKN2A, MEN1, ATM) rispettivamente 10, 8, 6 e 5 pazienti (un paziente ha avuto diagnosi di due GPVs). Nessun paziente con dg di GPVs nei geni BRCA1 e 2 presentava storia personale di cancro mammario o ovarico e solo un paziente aveva anamnesi di adenocarcinoma pancreatico. I pazienti con GPVs del gene MUTYH sono stati diagnosticati soprattutto per cancro colorettale (CRC) (n=5), ma nella loro storia personale sono presenti un NET pancreatico, un melanoma e un cancro gastrico. Nei pazienti giovani (<50 anni) con CCR stabile (n=23), sono state diagnosticate 4 GPVs (MDR=17%): MUTYH= 2, BRCA2=1 e APC=1. Il GOM TEGI contribuisce alla selezione dei pazienti che dovrebbero essere sottoposti a test genetico germinale. I risultati mostrano una forte sovrapposizione tra genotipi e fenotipi. Nuove indicazioni al test genetico germinale, come il risultato del sequenziamento genetico somatico, sono caratterizzate da un’elevata MDR.

Analisi di una serie consecutiva di 400 casi discussi al gruppo oncologico multidisciplinare tumori ereditari gastrointestinali dell'Azienda Ospedaliera Università di Padova-Istituto Oncologico Veneto.

ROSINA, ANDREA
2023/2024

Abstract

From March 2021 to June 2023, 402 patients were discussed at the multidisciplinary board for inherited gastrointestinal tumours of Padua Health District. Retrospectively, indications for discussion were categorized into the following: personal cancer history, early age at onset of cancer, familial cancer history, cancer histotypes, results of somatic genomic analysis, polyposis and management of patients with known inherited tumour syndrome. The recommendations to germline genetic testing were analysed in relation to the indications for discussion, and the mutation detection rate (MDR) was investigated. The results of germline genetic testing were analysed in relation to the indication for discussion. Every patient was presented using the AOUPD-IOV IT platform health-meeting by the care provider, the discussion took place online using the same platform. The study analysed 402 patients, 87 (21%) of them were young (<50-year-old) at the time of the multidisciplinary discussion, 65 (16%) were already diagnosed a genetic cancer syndrome, 363 (90%) had a personal history of cancer. The most frequent indication for the discussion was the family history of cancer (n=155, 27%), followed by result of somatic genomic analysis (n=91, 15%), which was a new prevalent indication for genetic cancer syndrome discussion. 193 (48%) patients received an indication for a germinal genetic testing, but just 153 (79%) of them underwent it. A GPV was diagnosed in 28 patients, making the overall MDR 18%. The indication for the germinal genetic testing with the highest MDR was the result of somatic genomic analysis (23%; p=0.02). The GPVs were found in the MMR genes, MUTYH, BRCA1/BRCA2 and other genes (APC, CDKN2A, MEN1, ATM), in 10, 8, 6 and 5 cases, respectively (one patient was diagnosed with 2 GPVs). In the group of patients with BRCA1/2 GPVs nobody had a personal history of breast or ovarian cancer and just one patient was diagnosed with pancreatic cancer. Patients with MUTYH GPVs were diagnosed mostly with colorectal cancer (n=5), but a pancreatic NET, a melanoma and a gastric cancer were found too. It was analysed the group of young patients (<50-year-old) with stable CRC (n=23) and 4 of them (17%) were diagnosed with a GPV (2 MUTYH, APC, BRCA2). The multidisciplinary board for inherited gastrointestinal tumours contributes selecting patients who should undergo germinal genetic testing. The results show a strong overlap between genotype and phenotype, making obsolete the current denomination of some hereditary cancer syndromes. At this point new indications to the germinal test are common and characterized by an elevated MDR, such as the result of somatic genomic analysis.
2023
Analysis of a consecutive serie of 400 cases discussed at the multidisciplinary board for inherited gastrointestinal tumors of Azienda Ospedaliera Università di Padova-Istituto Oncologico Veneto.
FI pazienti discussi al gruppo oncologico multidisciplinare dei tumori ereditari gastrointestinali (GOM TEGI) dell’Azienda Ospedaliera Università di Padova - Istituto Oncologico Veneto da marzo 2021 a giugno 2023, sono stati inclusi in questo studio retrospettivo. Al GOM TEGI hanno discusso casi professionisti sanitari da tutta la Regione Veneto e da due Unità della Regione Lombardia. Le indicazioni alla discussione sono state categorizzate in: storia oncologica personale, tumore giovanile, storia oncologica familiare, istotipo tumorale, risultato del sequenziamento genetico somatico, poliposi e management di pazienti con sindrome eredo-familiare nota. Le raccomandazioni al test genetico germinale sono state analizzate in relazione alle indicazioni alla discussione. I risultati del test genetico germinale sono stati analizzati in relazione alle indicazioni al test ed è stata calcolata la mutation detection rate (MDR) delle diverse indicazioni al test genetico. Ogni paziente è stato presentando dal care-provider utilizzato la piattaforma online condivisa tra AOUPD e IOV health-meeting®; la discussione è avvenuta usando la stessa piattaforma virtuale. Sono stati arruolati allo studio 402 pazienti, 87 (21%) di questi erano giovani (<50 anni) al momento della discussione; solo 65 (16%) avevano già ricevuto diagnosi di sindrome ereditaria, 363 (90%) aveva una storia personale di tumore. L’indicazione più frequente alla discussione multidisciplinare è stata la storia familiare oncologica (n=155, 27%), seguita dal risultato del sequenziamento somatico (n=91, 15%), Centonovantatre (48%) pazienti hanno ricevuto indicazione al test genetico germinale, ma solo 153 (79%) l’hanno eseguito. Varianti genetiche patogenetiche germinali (GPVs) sono state riscontrate in 28 pazienti, dimostrando una MDR generale del 18%. L’indicazione al test genetico germinale con la maggiore MDR è stata il risultato del sequenziamento somatico (23%, p=0.02). Sono state riscontrate GPVs ai danni dei geni MMR, MUTYH, BRCA1/2 e altri (APC, CDKN2A, MEN1, ATM) rispettivamente 10, 8, 6 e 5 pazienti (un paziente ha avuto diagnosi di due GPVs). Nessun paziente con dg di GPVs nei geni BRCA1 e 2 presentava storia personale di cancro mammario o ovarico e solo un paziente aveva anamnesi di adenocarcinoma pancreatico. I pazienti con GPVs del gene MUTYH sono stati diagnosticati soprattutto per cancro colorettale (CRC) (n=5), ma nella loro storia personale sono presenti un NET pancreatico, un melanoma e un cancro gastrico. Nei pazienti giovani (<50 anni) con CCR stabile (n=23), sono state diagnosticate 4 GPVs (MDR=17%): MUTYH= 2, BRCA2=1 e APC=1. Il GOM TEGI contribuisce alla selezione dei pazienti che dovrebbero essere sottoposti a test genetico germinale. I risultati mostrano una forte sovrapposizione tra genotipi e fenotipi. Nuove indicazioni al test genetico germinale, come il risultato del sequenziamento genetico somatico, sono caratterizzate da un’elevata MDR.
tumori ereditari
genetica
genomica
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