This bibliographic thesis explores the world of viruses, their characteristic fundamentals, how they are classified, and in particular focuses on the key aspects of their evolution. Through a detailed survey it goes on to analyze the structures of viruses, with a focus on capsids and the different architectures they can assume. The symmetry of the latter is also discussed, highlighting the differences between helical and icosahedral capsids, considering the implications of these structures on the ability of viruses to encapsulate their genome. The central core of this thesis is precisely on viral evolution and adaptation, with particular emphasis on the mechanisms of mutation, recombination and reassortment that drive the gene diversification of viruses. It goes on to explore the concept of viral fitness and the virus/host relationship, going to highlight how these kinds of interactions can influence the adaptation and coevolution of both parties. In particular, the viruses of myxoma and herpesvirus as examples to better analyze the concept of coevolution, highlighting the complex dynamics that govern such interactions. In addition, the role played by population size in the spread and persistence of the virus. In the last chapter, a magnifying glass is put on the SARS-CoV virus by analyzing its structure, evolution and mechanisms of interaction and host infection. This study provides an overview of the complexity of the evolutionary viral by going to analyze the different interactions that the virus can have with the host and the environment, seeking to bring order and clarity to a science in continuous study and change.

La presente tesi bibliografica esplora il mondo dei virus, le loro caratteristiche fondamentali, le modalità di classificazione, in particolare si concentra sugli aspetti chiave della loro evoluzione. Attraverso un’indagine dettagliata si va ad analizzare le strutture dei virus, con particolare attenzione ai capsidi e alle diverse architetture che posso assumere. Si discute inoltre la simmetria di quest’ultimi, evidenziando le differenze tra i capsidi elicoidali ed icosaedrici, considerando le implicazioni di tali strutture sulla capacità dei virus di incapsulare il proprio genoma. Il cuore centrale di questa tesi è proprio sull’evoluzione e l’adattamento virale, con particolare enfasi sui meccanismi di mutazione, ricombinazione e riassortimento che guidano la diversificazione genica dei virus. Si va ad esplorare il concetto di fitness virale ed il rapporto virus/ospite, andando ad evidenziare come questo tipo di interazioni possano influenzare l’adattamento e la coevoluzione di entrambe le parti. In particolare si studiano il virus del mixoma e dell’herpesvirus come esempi per analizzare al meglio il concetto di coevoluzione, evidenziando le dinamiche complesse che regolano tali interazioni. Si esamina, inoltre, il ruolo giocato dalle dimensioni delle popolazioni nella diffusione e persistenza del virus. Nell’ultimo capitolo si mette una lente di ingrandimento sul virus del SARS-CoV analizzando la sua struttura, la sua evoluzione ed i suoi meccanismi di interazione ed infezione dell’ospite. Il presente studio fornisce una panoramica sulla complessità dell’evoluzione virale, andando ad analizzare le diverse interazioni che il virus può avere con l’ospite e con l’ambiente, cercando di fare ordine e chiarezza su una scienza in continuo studio e cambiamento.

"Virus e Adattamento: Studio sull'Evoluzione Virale"

GAZZOLA, FRANCESCO
2023/2024

Abstract

This bibliographic thesis explores the world of viruses, their characteristic fundamentals, how they are classified, and in particular focuses on the key aspects of their evolution. Through a detailed survey it goes on to analyze the structures of viruses, with a focus on capsids and the different architectures they can assume. The symmetry of the latter is also discussed, highlighting the differences between helical and icosahedral capsids, considering the implications of these structures on the ability of viruses to encapsulate their genome. The central core of this thesis is precisely on viral evolution and adaptation, with particular emphasis on the mechanisms of mutation, recombination and reassortment that drive the gene diversification of viruses. It goes on to explore the concept of viral fitness and the virus/host relationship, going to highlight how these kinds of interactions can influence the adaptation and coevolution of both parties. In particular, the viruses of myxoma and herpesvirus as examples to better analyze the concept of coevolution, highlighting the complex dynamics that govern such interactions. In addition, the role played by population size in the spread and persistence of the virus. In the last chapter, a magnifying glass is put on the SARS-CoV virus by analyzing its structure, evolution and mechanisms of interaction and host infection. This study provides an overview of the complexity of the evolutionary viral by going to analyze the different interactions that the virus can have with the host and the environment, seeking to bring order and clarity to a science in continuous study and change.
2023
"Virus and Adaptation: Viral Evolution Study"
La presente tesi bibliografica esplora il mondo dei virus, le loro caratteristiche fondamentali, le modalità di classificazione, in particolare si concentra sugli aspetti chiave della loro evoluzione. Attraverso un’indagine dettagliata si va ad analizzare le strutture dei virus, con particolare attenzione ai capsidi e alle diverse architetture che posso assumere. Si discute inoltre la simmetria di quest’ultimi, evidenziando le differenze tra i capsidi elicoidali ed icosaedrici, considerando le implicazioni di tali strutture sulla capacità dei virus di incapsulare il proprio genoma. Il cuore centrale di questa tesi è proprio sull’evoluzione e l’adattamento virale, con particolare enfasi sui meccanismi di mutazione, ricombinazione e riassortimento che guidano la diversificazione genica dei virus. Si va ad esplorare il concetto di fitness virale ed il rapporto virus/ospite, andando ad evidenziare come questo tipo di interazioni possano influenzare l’adattamento e la coevoluzione di entrambe le parti. In particolare si studiano il virus del mixoma e dell’herpesvirus come esempi per analizzare al meglio il concetto di coevoluzione, evidenziando le dinamiche complesse che regolano tali interazioni. Si esamina, inoltre, il ruolo giocato dalle dimensioni delle popolazioni nella diffusione e persistenza del virus. Nell’ultimo capitolo si mette una lente di ingrandimento sul virus del SARS-CoV analizzando la sua struttura, la sua evoluzione ed i suoi meccanismi di interazione ed infezione dell’ospite. Il presente studio fornisce una panoramica sulla complessità dell’evoluzione virale, andando ad analizzare le diverse interazioni che il virus può avere con l’ospite e con l’ambiente, cercando di fare ordine e chiarezza su una scienza in continuo studio e cambiamento.
Virus
Evoluzione
Adattamento
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/67593