Sviluppo di marcatori microsatellite in lampreda padana (Lampetra zanandreai)

In questa tesi vengono sviluppati nuovi marcatori microsatellite per lo studio della lampreda padana (Lampetra zanandreai), un vertebrato acquatico agnato, quindi privo di mandibole e mascelle con corpo anguilliforme. Dal sequenziamento del suo genoma mediante Nanopore sono state individuate diverse sequenze microsatellite, ovvero sequenze di DNA ripetute che generalmente presentano un'elevata variabilità tra individui. Per ogni regione sono stati generati i rispettivi primers fiancheggianti la sequenza ripetuta, allo scopo di utilizzare la tecnica della PCR (Polymerase Chain Reaction) per amplificare il locus microsatellite. Il mio ruolo in questo studio è stato quello di provare la bontà dei primers disegnati, utilizzando la PCR sul DNA estratto da 4 individui diversi di lampreda padana provenienti, rispettivamente, da Piemonte, Marche, Veneto e Friuli-Venezia Giulia e selezionare i migliori 16 loci in base ai risultati della corsa in gel di agarosio. Questi 16 loci permetteranno di investigare la genetica di popolazione della lampreda padana e contribuire alla sua conservazione.