Il ruolo delle uORFs codificanti uPeptidi e ligandi HLA nella regolazione dell'espressione genica a livello traduzionale in trascritti associati al cancro.

Le upstream open reading frame (uORFs) sono brevi sequenze codificanti, situate nella regione 5’UTR dei trascritti eucariotici, coinvolte nella regolazione dell’espressione genica a livello traduzionale del trascritto a valle a cui sono associate. Dati recenti hanno dimostrato che queste sequenze possono codificare per proteine biologicamente attive e per peptidi presentati dalle molecole HLA, suggerendo una loro implicazione nello sviluppo e nella sopravvivenza delle cellule tumorali. Nello studio riportato è stato esaminato l’effetto regolatorio di 29 uORFs associate a 13 trascritti correlati al cancro osservando l’espressione cellulare e la localizzazione degli uPeptidi mediante immunoblotting e immunofluorescenza. In seguito è stata eseguita l’analisi dell’immunopeptidoma basata sulla spettrometria di massa al fine di identificare peptidi derivati dalle uORF e presentati in HLA. I risultati ottenuti hanno rivelato una frequente espressione delle uORF in uPeptidi caratterizzati da una localizzazione cellulare specifica nei tessuti umani benigni e maligni suggerendo un ruolo regolatorio diffuso delle uORF e degli uPeptidi in un contesto tumorale. Inoltre, tramite analisi di tipo comparativo, utilizzando immunopeptidomi derivati da tessuti benigni e maligni, è stato possibile delineare un insieme di ligandi HLA derivati dalle uORF associati al tumore in grado di indurre una risposta specifica da parte dei linfociti T.