In this thesis, the study conducted by Zhang and colleagues, titled “8-oxoguanine DNA glycosylase-1 may serve as a biomarker of mechanical asphyxia”, is analyzed. The aim of the study is to identify potential specific biomarkers for predicting deaths caused by mechanical asphyxia. To this end, two main parameters were analyzed: mitochondrial DNA (mtDNA) integrity and the expression of 8-oxoguanine DNA glycosylase-1 (OGG1). The H9C2 cell line was transfected with vector constructs to induce OGG1 overexpression and to achieve targeted gene silencing of 8-oxoguanine DNA glycosylase-1 using siRNA-OGG1. This approach allowed for the determination of OGG1’s function and the investigation of its influence on other factors such as TFAM, NRF1, Bcl2, Caspase-3, and physiological parameters including mitochondrial membrane potential (MMP) and ATP concentration. The results showed that in the hypoxia-treated group, mtDNA integrity decreased, whereas OGG1 expression sharply increased. In the H9C2 cell line subjected to hypoxia, OGG1 expression peaked and then gradually declined. The study also revealed that OGG1 downregulated Caspase-3 expression and suggested that OGG1 plays a role in restoring mitochondrial DNA integrity and maintaining organelle function. In the control group under normoxic conditions, N-acetylcysteine (NAC) preserved DNA integrity while reducing both MMP and ATP concentration. Based on the data obtained, it was concluded that the two analyzed factors may serve as molecular markers for identifying deaths caused by mechanical asphyxia.

In questo elaborato di tesi viene analizzato lo studio condotto da Zhang e colleghi, dal titolo “8-oxoguanine DNA glycosylase-1 may serve as biomarker of mechanical asphyxia” il cui obiettivo è quello di identificare potenziali biomarker specifici per predire decessi per asfissia meccanica. A tal fine, sono stati analizzati due parametri principali: l'integrità del DNA mitocondriale (mtDNA) e l'espressione di OGG1. La linea cellulare H9C2 è stata trasfettata con dei costrutti per indurre sovraespressione e silenziamento tramite si-RNA. Questo ha permesso di determinare la funzione di OGG1 e studiare la sua influenza nei confronti di altri fattori come TFAM, NRF1, Bcl2, Caspasi-3, oltre a parametri fisiologici come il potenziale di membrana mitocondriale (MMP) e i livelli di ATP. I risultati ottenuti indicano che, nel gruppo ipossico, l'integrità del DNA è diminuita mentre l'espressione di OGG1 è aumentata drasticamente. Nella linea cellulare indotta ad ipossia, OGG1 ha raggiunto un picco di espressione seguito da un calo graduale. Lo studio, inoltre, ha evidenziato che OGG1 down-regola l'espressione della Caspasi-3, favorisce il ripristino dell'integrità del DNA mitocondriale e della funzione mitocondriale. Nel gruppo di controllo in normossia, il trattamento con NAC (N-acetil cisteina) ha preservato l'integrità del mtDNA riducendo però MMP e livelli di ATP. Si è giunti quindi alla conclusione che, in base ai dati ottenuti, mtDNA e OGG1 possono essere marcatori molecolari per identificare decessi per asfissia meccanica.

8-ossoguanina DNA glicosilasi-1: un potenziale biomarker per l'asfissia meccanica

ALBIERO, ALESSANDRA
2024/2025

Abstract

In this thesis, the study conducted by Zhang and colleagues, titled “8-oxoguanine DNA glycosylase-1 may serve as a biomarker of mechanical asphyxia”, is analyzed. The aim of the study is to identify potential specific biomarkers for predicting deaths caused by mechanical asphyxia. To this end, two main parameters were analyzed: mitochondrial DNA (mtDNA) integrity and the expression of 8-oxoguanine DNA glycosylase-1 (OGG1). The H9C2 cell line was transfected with vector constructs to induce OGG1 overexpression and to achieve targeted gene silencing of 8-oxoguanine DNA glycosylase-1 using siRNA-OGG1. This approach allowed for the determination of OGG1’s function and the investigation of its influence on other factors such as TFAM, NRF1, Bcl2, Caspase-3, and physiological parameters including mitochondrial membrane potential (MMP) and ATP concentration. The results showed that in the hypoxia-treated group, mtDNA integrity decreased, whereas OGG1 expression sharply increased. In the H9C2 cell line subjected to hypoxia, OGG1 expression peaked and then gradually declined. The study also revealed that OGG1 downregulated Caspase-3 expression and suggested that OGG1 plays a role in restoring mitochondrial DNA integrity and maintaining organelle function. In the control group under normoxic conditions, N-acetylcysteine (NAC) preserved DNA integrity while reducing both MMP and ATP concentration. Based on the data obtained, it was concluded that the two analyzed factors may serve as molecular markers for identifying deaths caused by mechanical asphyxia.
2024
8-oxoguanine DNA glycosylase-1: a potential biomarker for mechanical asphyxia
In questo elaborato di tesi viene analizzato lo studio condotto da Zhang e colleghi, dal titolo “8-oxoguanine DNA glycosylase-1 may serve as biomarker of mechanical asphyxia” il cui obiettivo è quello di identificare potenziali biomarker specifici per predire decessi per asfissia meccanica. A tal fine, sono stati analizzati due parametri principali: l'integrità del DNA mitocondriale (mtDNA) e l'espressione di OGG1. La linea cellulare H9C2 è stata trasfettata con dei costrutti per indurre sovraespressione e silenziamento tramite si-RNA. Questo ha permesso di determinare la funzione di OGG1 e studiare la sua influenza nei confronti di altri fattori come TFAM, NRF1, Bcl2, Caspasi-3, oltre a parametri fisiologici come il potenziale di membrana mitocondriale (MMP) e i livelli di ATP. I risultati ottenuti indicano che, nel gruppo ipossico, l'integrità del DNA è diminuita mentre l'espressione di OGG1 è aumentata drasticamente. Nella linea cellulare indotta ad ipossia, OGG1 ha raggiunto un picco di espressione seguito da un calo graduale. Lo studio, inoltre, ha evidenziato che OGG1 down-regola l'espressione della Caspasi-3, favorisce il ripristino dell'integrità del DNA mitocondriale e della funzione mitocondriale. Nel gruppo di controllo in normossia, il trattamento con NAC (N-acetil cisteina) ha preservato l'integrità del mtDNA riducendo però MMP e livelli di ATP. Si è giunti quindi alla conclusione che, in base ai dati ottenuti, mtDNA e OGG1 possono essere marcatori molecolari per identificare decessi per asfissia meccanica.
Asfissia meccanica
Biomarker
Ipossia
File in questo prodotto:
File Dimensione Formato  
Albiero_Alessandra.pdf

Accesso riservato

Dimensione 1.75 MB
Formato Adobe PDF
1.75 MB Adobe PDF

The text of this website © Università degli studi di Padova. Full Text are published under a non-exclusive license. Metadata are under a CC0 License

Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/91929