Analisi filogenomiche mitocondriali dei vertebrati agnati

Gli agnati sono tra i vertebrati più antichi comparsi. Nonostante questo e la loro importanza a livello evolutivo nel contesto dei vertebrati, la loro filogenesi è ancora oggetto di discussione. Di questo gruppo di organismi, attualmente esistono solo due cladi principali: missine (Myxiniformes) e lamprede (Petromyzontiformes). In questo lavoro sono stati analizzati un totale di 57 genomi mitocondriali comprendenti diverse specie di missine e lamprede. I mitogenomi analizzati provengono da database come Genebank e da campioni di popolazioni delle specie di Lampetra zanandreai e Lampetra soljani, dalle quali sono stati assemblati mitogenomi de novo tramite il software MitoZ. Sono stati poi estratti i geni codificanti per le proteine dai mitogenomi e concatenati in un unica supermatrice, poi partizionata con PartitionFinder. Da questi dati è stato possibile ricostruire degli alberi filogenetici che mostrano le relazioni filogenetiche tra le specie coinvolte. Questo è stato fatto tramite due metodi quali la massima verosimiglianza (con IQ-TREE) e l'inferenza bayesiana (con MrBayes). I risultati sono stati analizzati e confrontati con lavori precedenti riguardanti l'argomento. Il lavoro fornisce una rappresentazione delle relazioni tra gli agnati, soffermandosi principalmente sul gruppo delle lamprede e sulle popolazioni campionate. I risultati appaiono coerenti con studi precedenti, confermando affermazioni e incertezze nelle relazioni filogenetiche all'interno di questo gruppo di organismi.