Ovarian carcinoma represents one of the leading causes of cancer-related mortality in women and it is characterized by a complex and strongly immunosuppressive tumor microenvironment. The aim of the present work was to analyze the composition and distribution of the cellular subpopulations constituting the immune infiltrate associated with ovarian carcinoma, by integrating flow cytometry and single-cell RNA sequencing approaches. To this end, CD45+ immune cells were isolated from ascitic fluid samples of affected patients and subjected to high-resolution phenotypic and transcriptomic analyses. The data obtained allowed the identification and quantification of the major immune populations, with particular attention to CD8+ cytotoxic T lymphocytes, CD4+ helper T lymphocytes, regulatory T lymphocytes, B lymphocytes and other non-lymphoid immune cells. The detailed analysis of the immune profile revealed a peculiar balance between the effector and regulatory components. An in-depth study on a larger patient cohort will be conducted to correlate specific immunological profiles with defined tumor prognoses, with the ultimate goal of suggesting potential personalized immunotherapy approaches.

Il carcinoma ovarico rappresenta una delle principali cause di mortalità oncologica femminile ed è caratterizzato da un microambiente tumorale complesso e fortemente immunosoppressivo. Scopo del presente lavoro è stato analizzare la composizione e la distribuzione delle sottopopolazioni cellulari che compongono l’infiltrato immunitario associato al carcinoma ovarico, integrando approcci di citofluorimetria a flusso e sequenziamento dell’RNA a singola cellula. A tal fine, le cellule immunitarie CD45+ sono state isolate dai campioni di fluido ascitico di pazienti affette e sono state sottoposte ad analisi fenotipica e trascrittomica ad alta risoluzione. I dati ottenuti hanno permesso di identificare e quantificare le principali popolazioni immunitarie, con particolare attenzione a linfociti T citotossici CD8+, linfociti T helper CD4+, linfociti T regolatori, linfociti B e altre cellule immunitarie non linfocitarie. L’analisi dettagliata del profilo immunitario ha messo in luce un equilibrio peculiare tra la componente effettrice e quella regolatoria. Un’approfondita indagine su una coorte di pazienti più ampia sarà condotta per correlare specifici profili immunologici con determinate prognosi tumorali, al fine di suggerire possibili approcci di immunoterapia personalizzata.

Analisi del profilo immunitario del microambiente tumorale ovarico attraverso un approccio multiomico

MATRANGA, VIRGINIA
2024/2025

Abstract

Ovarian carcinoma represents one of the leading causes of cancer-related mortality in women and it is characterized by a complex and strongly immunosuppressive tumor microenvironment. The aim of the present work was to analyze the composition and distribution of the cellular subpopulations constituting the immune infiltrate associated with ovarian carcinoma, by integrating flow cytometry and single-cell RNA sequencing approaches. To this end, CD45+ immune cells were isolated from ascitic fluid samples of affected patients and subjected to high-resolution phenotypic and transcriptomic analyses. The data obtained allowed the identification and quantification of the major immune populations, with particular attention to CD8+ cytotoxic T lymphocytes, CD4+ helper T lymphocytes, regulatory T lymphocytes, B lymphocytes and other non-lymphoid immune cells. The detailed analysis of the immune profile revealed a peculiar balance between the effector and regulatory components. An in-depth study on a larger patient cohort will be conducted to correlate specific immunological profiles with defined tumor prognoses, with the ultimate goal of suggesting potential personalized immunotherapy approaches.
2024
A multiomic approach to dissect the immune landscape of the ovarian tumor microenvironment
Il carcinoma ovarico rappresenta una delle principali cause di mortalità oncologica femminile ed è caratterizzato da un microambiente tumorale complesso e fortemente immunosoppressivo. Scopo del presente lavoro è stato analizzare la composizione e la distribuzione delle sottopopolazioni cellulari che compongono l’infiltrato immunitario associato al carcinoma ovarico, integrando approcci di citofluorimetria a flusso e sequenziamento dell’RNA a singola cellula. A tal fine, le cellule immunitarie CD45+ sono state isolate dai campioni di fluido ascitico di pazienti affette e sono state sottoposte ad analisi fenotipica e trascrittomica ad alta risoluzione. I dati ottenuti hanno permesso di identificare e quantificare le principali popolazioni immunitarie, con particolare attenzione a linfociti T citotossici CD8+, linfociti T helper CD4+, linfociti T regolatori, linfociti B e altre cellule immunitarie non linfocitarie. L’analisi dettagliata del profilo immunitario ha messo in luce un equilibrio peculiare tra la componente effettrice e quella regolatoria. Un’approfondita indagine su una coorte di pazienti più ampia sarà condotta per correlare specifici profili immunologici con determinate prognosi tumorali, al fine di suggerire possibili approcci di immunoterapia personalizzata.
Ovarian cancer
Immune system
Single cell
Flow cytometry
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