SVILUPPO DI LIGANDI PEPTIDICI CON BERSAGLIO LA REGIONE 3’-UTR DELL’RNA GENOMICO DEL VIRUS WEST NILE

Il virus West Nile, appartenente alla famiglia Flaviviridae, causa infezioni per lo più asintomatiche o con sintomi simil-influenzali. Tuttavia, in soggetti anziani o immunocompromessi, può provocare gravi complicanze neurologiche come meningiti ed encefaliti. Ad oggi non sono disponibili né farmaci antivirali specifici, né un vaccino contro il virus e questo rende urgente lo sviluppo di nuove strategie terapeutiche. Un possibile bersaglio per interventi farmacologici è la regione 3’-UTR del genoma a RNA del virus, altamente conservata e fondamentale per la replicazione virale. In particolare, il Dominio 2 di questa regione, costituito da due pseudoknot intrecciati, si presenta come un target promettente. In questa tesi, abbiamo cercato di identificare ligandi peptidici capaci di riconoscere il Dominio 2 del 3’UTR del genoma virale. Il Dominio 2 è stato amplificato e trascritto in vitro, ottimizzandone le condizioni di folding per garantire una corretta strutturazione dell’RNA. È stata quindi impiegata la tecnica del Phage Display, utilizzando una libreria di fagi esprimenti eptapeptidi ciclici, per selezionare ligandi peptidici con elevata affinità per il bersaglio virale. I dati di questa tesi rappresentano il punto di partenza per la progettazione di un sistema RiboTAC, capace di riconoscere e degradare selettivamente l’RNA virale.