Diagnosi molecolare di un soggetto affetto da malattia correlata al gene CFTR (CFTR-Related Disorders)

Il gene CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator), localizzato sul cromosoma 7 (7q31.2), codifica una glicoproteina transmembrana di 1480 amminoacidi che agisce come un canale per il trasporto di ioni cloro (Cl-) attraverso la membrana cellulare degli epiteli. Le varianti patogenetiche di CFTR (ad oggi oltre 2.100), tra cui la più frequente è F508del, sono classificate in sei classi in base al loro meccanismo patogenetico; le varianti patogenetiche, secondo un modello di ereditarietà autosomico-recessiva, sono responsabili di uno spettro clinico che comprende la Fibrosi Cistica (FC), una malattia multisistemica caratterizzata principalmente da infezioni respiratorie croniche e insufficienza pancreatica esocrina, e malattie correlate al gene CFTR (CFTR-RD), quest’ultime condizioni che clinicamente non soddisfano i criteri diagnostici della FC e che tipicamente colpiscono un singolo organo. Nel presente lavoro vengono presentati i risultati dell’analisi molecolare di I° livello del gene CFTR, condotta mediante sequenziamento di nuova generazione (Next Generation Sequencing, NGS) in un paziente adulto con bronchiectasie ricorrenti. Il DNA genomico, estratto da sangue periferico, è stato analizzato per 371 varianti note, di cui 338 causative di FC e 33 associate a conseguenze cliniche variabili. L’analisi ha identificato due varianti in verosimile eterozigosi composta: 1) c.115C>T (p.Gln39X), una variante patogenetica di tipo nonsense (classe I), documentata nel database CFTR2 come ‘variante causativa di FC’, che determina una proteina prematuramente tronca; 2) c.1584+18672A>G, una variante intronica profonda con evidenza funzionale di ritenzione intronica che è descritta in letteratura come associata a fenotipi CFTR-RD e classificabile come “variante a conseguenza clinica variabile”. La combinazione genotipica ‘in trans’ di queste varianti risulterebbe compatibile con il quadro clinico del paziente caratterizzato da bronchiectasie ricorrenti a esordio in età adulta, senza coinvolgimento pancreatico, né infertilità maschile. La diagnosi molecolare ha confermato il sospetto clinico di CFTR-RD, secondo le più recenti raccomandazioni della Società Europea per la Fibrosi Cistica (ECFS). L’approccio NGS di I livello ha consentito di giungere a una diagnosi definitiva in un paziente precedentemente classificato come portatore sano, evidenziando una sensibilità diagnostica superiore (detection rate ~90% nella popolazione italiana) rispetto a quella dei metodi tradizionali, quali il reverse dot blot. La caratterizzazione del genotipo CFTR ha permesso l’inserimento del paziente in un percorso di monitoraggio clinico specialistico presso un Centro Regionale FC e riveste un'importante valenza in ambito di consulenza genetica familiare in quanto permetterà l'identificazione di eventuali portatori nella famiglia.