ABSTRACT INTRODUCTION. Human papillomaviruses (HPV) are among the most common pathogens affecting humans, and genital HPV infection is considered the most common sexually transmitted disease. Although most infected people remain asymptomatic and clear the infection, some individuals may develop persistent or recurrent benign lesions, while others may develop precancerous lesions and cancer. For this reason, it is important to adhere to regional DNA-HPV screening programs. In addition, extensive genotyping of the HPV virus in the cervico-vaginal, anal, and oral areas is a very informative diagnostic response at the clinical level because it allows for the stratification of patient risk: This study therefore aims to evaluate the performance of the new CE-IVD-marked HPV Selfy diagnostic system (Hyris - Trieste, IT) for possible inclusion in the diagnostic routine to replace the home-made method currently in use. MATERIALS AND METHODS. The analytical request for xxxx fresh cervical-vaginal cell suspensions and xxx cervical-vaginal and/or anal biopsies embedded in paraffin is the determination of extended genotyping. The samples were processed by cell lysis and/or total DNA was extracted. They were then analyzed using the gold standard PCR-RFLP method used in routine diagnostics at the IOV's “HPV Laboratory” and with the HPV Selfy diagnostic system using multiplex qPCR and subsequent analysis of melting temperatures (HRM). RESULTS. The extended genotyping results obtained with the two methods are ……% concordant...

RIASSUNTO INTRODUZIONE. I papilloma virus umani (HPV) sono tra i patogeni più comuni che colpiscono gli esseri umani e l'infezione genitale da HPV è considerata la malattia sessualmente trasmissibile più comune. Sebbene la maggior parte delle persone infette rimanga asintomatica ed elimini l'infezione, alcuni individui possono presentare lesioni benigne persistenti o ricorrenti, mentre altri possono sviluppare lesioni precancerose e cancro. Per questo motivo, è importante l’adesione ai programmi regionali di screening DNA-HPV. Inoltre la genotipizzazione estesa del virus HPV nel distretto cervico-vaginale, anale e buccale risulta essere una risposta diagnostica molto informativa a livello clinico perchè permette la stratificazione del rischio del paziente: questo studio ha perciò lo scopo di valutare le performance del nuovo sistema diagnostico marcato CE-IVD HPV Selfy (Hyris - Trieste, IT) per un eventuale inserimento nella routine diagnostica in sostituzione al metodo home-made in uso attualmente. MATERIALI E METODI. La richiesta analitica di xxxx sospensioni fresche di cellule cervico-vaginali e xxx biopsie cervico-vaginali e/o anali incluse in paraffina è la determinazione della genotipizzazione estesa. I campioni sono stati processati mediante lisi cellulare e/o ne è stato estratto il DNA totale. Successivamente sono stati analizzati mediante metodica gold standard PCR-RFLP in uso nella routine diagnostica del “Laboratorio HPV” dello IOV e con il sistema diagnostico HPV Selfy mediante qPCR multiplex e successiva analisi delle temperature di melting (HRM). RISULTATI. I risultati di genotipizzazione estesa ottenuti con le 2 metodiche sono ……% concordanti… CONCLUSIONE.

Valutazione di un nuovo sistema diagnostico per il rilevamento e la genotipizzazione estesa di papillomavirus umani (HPV) in cellule cervico-vaginali mediante qPCR-HRM multiplex su dispositivo miniaturizzato

MOZZO, VALENTINA
2024/2025

Abstract

ABSTRACT INTRODUCTION. Human papillomaviruses (HPV) are among the most common pathogens affecting humans, and genital HPV infection is considered the most common sexually transmitted disease. Although most infected people remain asymptomatic and clear the infection, some individuals may develop persistent or recurrent benign lesions, while others may develop precancerous lesions and cancer. For this reason, it is important to adhere to regional DNA-HPV screening programs. In addition, extensive genotyping of the HPV virus in the cervico-vaginal, anal, and oral areas is a very informative diagnostic response at the clinical level because it allows for the stratification of patient risk: This study therefore aims to evaluate the performance of the new CE-IVD-marked HPV Selfy diagnostic system (Hyris - Trieste, IT) for possible inclusion in the diagnostic routine to replace the home-made method currently in use. MATERIALS AND METHODS. The analytical request for xxxx fresh cervical-vaginal cell suspensions and xxx cervical-vaginal and/or anal biopsies embedded in paraffin is the determination of extended genotyping. The samples were processed by cell lysis and/or total DNA was extracted. They were then analyzed using the gold standard PCR-RFLP method used in routine diagnostics at the IOV's “HPV Laboratory” and with the HPV Selfy diagnostic system using multiplex qPCR and subsequent analysis of melting temperatures (HRM). RESULTS. The extended genotyping results obtained with the two methods are ……% concordant...
2024
Evaluation of a new diagnostic system for the detection and extensive genotyping of human papillomaviruses (HPV) in cervicovaginal cells by multiplex qPCR-HRM on miniaturized device
RIASSUNTO INTRODUZIONE. I papilloma virus umani (HPV) sono tra i patogeni più comuni che colpiscono gli esseri umani e l'infezione genitale da HPV è considerata la malattia sessualmente trasmissibile più comune. Sebbene la maggior parte delle persone infette rimanga asintomatica ed elimini l'infezione, alcuni individui possono presentare lesioni benigne persistenti o ricorrenti, mentre altri possono sviluppare lesioni precancerose e cancro. Per questo motivo, è importante l’adesione ai programmi regionali di screening DNA-HPV. Inoltre la genotipizzazione estesa del virus HPV nel distretto cervico-vaginale, anale e buccale risulta essere una risposta diagnostica molto informativa a livello clinico perchè permette la stratificazione del rischio del paziente: questo studio ha perciò lo scopo di valutare le performance del nuovo sistema diagnostico marcato CE-IVD HPV Selfy (Hyris - Trieste, IT) per un eventuale inserimento nella routine diagnostica in sostituzione al metodo home-made in uso attualmente. MATERIALI E METODI. La richiesta analitica di xxxx sospensioni fresche di cellule cervico-vaginali e xxx biopsie cervico-vaginali e/o anali incluse in paraffina è la determinazione della genotipizzazione estesa. I campioni sono stati processati mediante lisi cellulare e/o ne è stato estratto il DNA totale. Successivamente sono stati analizzati mediante metodica gold standard PCR-RFLP in uso nella routine diagnostica del “Laboratorio HPV” dello IOV e con il sistema diagnostico HPV Selfy mediante qPCR multiplex e successiva analisi delle temperature di melting (HRM). RISULTATI. I risultati di genotipizzazione estesa ottenuti con le 2 metodiche sono ……% concordanti… CONCLUSIONE.
HPV
genotipizzazione
qPCR
HRM
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/93901