The von Willebrand factor (vWF) is a high-molecular-weight multimeric plasma protein essential for primary hemostasis. Its ultra-large multimers are particularly thrombogenic. The enzyme ADAMTS-13 regulates their size by cleaving the Tyr1605-Met1606 bond. However, under pathological conditions such as type 2 diabetes, oxidative stress can oxidize Met1606 to methionine sulfoxide, thereby inhibiting proteolysis by ADAMTS-13 and promoting the accumulation of high-molecular-weight oligomers, with an increased thrombotic risk. ADAMTS-13 itself can also be inactivated by oxidation, further worsening the condition. This thesis aims to analyze the oxidation level of Met1606 by mass spectrometry in order to develop a diagnostic test. A protocol for vWF enrichment from small plasma volumes was optimized through depletion of the most abundant proteins. Among the tested methods (dialysis, filtration, ethanol-based albumin depletion), strong anion-exchange chromatography proved to be the most effective, yielding a vWF-enriched fraction. Its presence was confirmed by SDS-PAGE, Western Blot, and LC-MS/MS. For the identification and quantification of oxidized Met1606, mass spectrometry coupled with multi-enzyme digestion on filter (MED-FASP) was employed. This approach enabled the detection of Met1606 and its oxidative state, confirming the validity of the proposed strategy.

Il fattore di von Willebrand (vWF) è una proteina plasmatica multimerica ad alto peso molecolare essenziale per l’emostasi primaria. I suoi multimeri ultra-large sono particolarmente trombogenici. L’enzima ADAMTS-13 ne regola la dimensione scindendo il legame Tyr1605-Met1606. Tuttavia, in condizioni patologiche come il diabete di tipo 2, lo stress ossidativo può ossidare la Met1606 a metionina solfossido, inibendo la proteolisi da parte di ADAMTS-13 e favorendo l’accumulo di oligomeri ad alto peso molecolare, con aumento del rischio trombotico. Anche ADAMTS-13 può essere inattivato dall’ossidazione, aggravando la condizione. Questa Tesi mira ad analizzare il livello di ossidazione della Met1606 tramite spettrometria di massa per sviluppare un test diagnostico. È stato ottimizzato un protocollo di arricchimento del vWF da piccoli volumi di plasma mediante rimozione delle proteine più abbondanti. Tra i metodi testati (dialisi, filtrazione, deplezione etanolica dell’albumina), la cromatografia a scambio anionico forte è risultata la più efficace, permettendo l’ottenimento di una frazione arricchita in vWF. La sua presenza è stata confermata tramite SDS-PAGE, Western Blot e LC-MS/MS. Per l’identificazione e la quantificazione della Met1606 ossidata si è utilizzata la spettrometria di massa accoppiata alla digestione multienzimatica su filtro (MED-FASP). L’approccio ha permesso di rilevare Met1606 e il relativo stato ossidativo, confermando la validità della strategia proposta.

Sviluppo di metodi di spettrometria di massa per l'identificazione e quantificazione di modifiche ossidative pro-trombotiche del fattore di von Willebrand

REGINATO, DENISE
2024/2025

Abstract

The von Willebrand factor (vWF) is a high-molecular-weight multimeric plasma protein essential for primary hemostasis. Its ultra-large multimers are particularly thrombogenic. The enzyme ADAMTS-13 regulates their size by cleaving the Tyr1605-Met1606 bond. However, under pathological conditions such as type 2 diabetes, oxidative stress can oxidize Met1606 to methionine sulfoxide, thereby inhibiting proteolysis by ADAMTS-13 and promoting the accumulation of high-molecular-weight oligomers, with an increased thrombotic risk. ADAMTS-13 itself can also be inactivated by oxidation, further worsening the condition. This thesis aims to analyze the oxidation level of Met1606 by mass spectrometry in order to develop a diagnostic test. A protocol for vWF enrichment from small plasma volumes was optimized through depletion of the most abundant proteins. Among the tested methods (dialysis, filtration, ethanol-based albumin depletion), strong anion-exchange chromatography proved to be the most effective, yielding a vWF-enriched fraction. Its presence was confirmed by SDS-PAGE, Western Blot, and LC-MS/MS. For the identification and quantification of oxidized Met1606, mass spectrometry coupled with multi-enzyme digestion on filter (MED-FASP) was employed. This approach enabled the detection of Met1606 and its oxidative state, confirming the validity of the proposed strategy.
2024
Development of mass spectrometry methods for the identification and quantification of pro-thrombotic oxidative modifications of von Willebrand factor
Il fattore di von Willebrand (vWF) è una proteina plasmatica multimerica ad alto peso molecolare essenziale per l’emostasi primaria. I suoi multimeri ultra-large sono particolarmente trombogenici. L’enzima ADAMTS-13 ne regola la dimensione scindendo il legame Tyr1605-Met1606. Tuttavia, in condizioni patologiche come il diabete di tipo 2, lo stress ossidativo può ossidare la Met1606 a metionina solfossido, inibendo la proteolisi da parte di ADAMTS-13 e favorendo l’accumulo di oligomeri ad alto peso molecolare, con aumento del rischio trombotico. Anche ADAMTS-13 può essere inattivato dall’ossidazione, aggravando la condizione. Questa Tesi mira ad analizzare il livello di ossidazione della Met1606 tramite spettrometria di massa per sviluppare un test diagnostico. È stato ottimizzato un protocollo di arricchimento del vWF da piccoli volumi di plasma mediante rimozione delle proteine più abbondanti. Tra i metodi testati (dialisi, filtrazione, deplezione etanolica dell’albumina), la cromatografia a scambio anionico forte è risultata la più efficace, permettendo l’ottenimento di una frazione arricchita in vWF. La sua presenza è stata confermata tramite SDS-PAGE, Western Blot e LC-MS/MS. Per l’identificazione e la quantificazione della Met1606 ossidata si è utilizzata la spettrometria di massa accoppiata alla digestione multienzimatica su filtro (MED-FASP). L’approccio ha permesso di rilevare Met1606 e il relativo stato ossidativo, confermando la validità della strategia proposta.
vWF
ossidazione
spettrometria
infiammazione
trombosi
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