Caratterizzazione cinetica ed energetica di un biosensore a DNA tramite le pinzette ottiche

La modulazione dell'affinità di un biosensore verso la propria molecola bersaglio attraverso meccanismi allosterici rappresenta un aspetto cruciale in numerose applicazioni, che spaziano dalla biosensoristica al trasporto di nanofarmaci. In questa tesi vengono investigate le proprietà elastiche, cinetiche ed energetiche di un biosensore a DNA progettato per riconoscere e legarsi alla proteina TATA-binding (TBP). Utilizzando le pinzette ottiche, sono state effettuate misure di spettroscopia di forza a livello di singola molecola, al fine di caratterizzare la struttura secondaria del biosensore, a doppio hairpin. Così sono state determinate le costanti elastiche, cinetiche e l'energia libera di formazione. La struttura del biosensore, tramite gli esperimenti di pulling, cambia conformazione: sono state rilevate sia l'apertura dell'hairpin con energia libera maggiore che il dispiegamento della struttura intera, a seconda della velocità di tiraggio.