Nuovi approcci genomici nell'analisi delle interazioni virus-procarioti nei biofilm delle sorgenti termali.

I procarioti sono i modelli di vita più antichi presenti sulla terra. La grande capacità di adattamento che possiedono permette loro di colonizzare ogni tipo di ambiente, anche quelli più estremi, come quelli caratterizzati dalle elevate temperature delle sorgenti termali analizzati in questo studio. In questi ambienti questi microorganismi secernono materiale organico, creando così un ambiente per molti aspetti isolato dall’esterno. I biofilm tendono ad essere multi-stratificati e accolgono al loro interno un complesso ecosistema di diverse specie interdipendenti. Date le condizioni presenti all’interno di questi biofilm si crea un ambiente ideale ad ospitare un gran numero di virus che infettano archaea e batteri. Lo studio qui proposto, con tecniche innovative come il sequenziamento a singola cellula, si pone come obiettivo una migliore comprensione delle interazioni che coinvolgono questi virus e i loro ospiti. I risultati ottenuti hanno evidenziato una chiara prevalenza del ciclo lisogenico. Inoltre, è emersa una compartimentalizzazione delle varie specie di virali delimitate dagli strati dei biofilm. Le tecniche di single cell genomics hanno permesso infine di individuare nuove specie virali e procariotiche desumendo anche i rapporti che li uniscono.