Simulazione di un semplice sistema chimico: sensing in un regime di non-equilibrio

In a recent publication, Nicoletti et al. proposed a simple model of non-equilibrium sensing including a receptor, a readout, and a storage unit. In the limit of a perfect separation of the main time scales involved, they were able to exactly solve the relevant master equations and show that the storage unit can stabilize the sensing process. Here, we aim to reproduce the main results of Nicoletti et al. in a numerical simulation, and investigate to what extent the simulation aligns with the analytical prediction.

In una recente pubblicazione, Nicoletti et al. hanno proposto un semplice modello per il sensing in regime di non-equilibrio, che comprende un recettore, un'unità di readout e un'unità di storage. Nel limite di perfetta separazione delle principali scale temporali coinvolte, sono stati in grado di risolvere esattamente le master equations rilevanti per il sistema e mostrare che l'unità di storage può stabilizzare il processo di sensing. In questo lavoro vogliamo riprodurre i principali risultati di Nicoletti et al. attraverso una simulazione numerica, e verificare in che misura la simulazione riflette le predizioni analitiche.