Validation of a drought stress protocol for Solanum Lycopersicum

Tomato (Solanum lycopersicum) is a key crop worldwide, valued for both its economic and research significance. Drought stress, a major challenge in tomato cultivation, negatively affects plant growth, physiology, and productivity. This study investigates the drought response of two tomato varieties, M82 and Red Setter, focusing on morphological and physiological responses to drought; furthermore, it evaluates the setup protocol that allows to analyse the epigenetic changes in response to drought. The aim of this study is to define a drought stress protocol that can be easily replicated and a laboratory setup protocol to prepare the samples for ChIP-seq epigenome analysis. The definition of a protocol to follow for further stresses and laboratory practices is needed to later study the development of a ‘stress memory’ in plants, analyse the differences in the response to a subsequent stress and understand the underlying mechanisms of ‘stress memory’.

Il pomodoro (Solanum lycopersicum) è una coltura chiave a livello mondiale, apprezzata sia per la sua importanza economica che per la ricerca. Lo stress idrico, una delle principali sfide nella coltivazione del pomodoro, influisce negativamente sulla crescita, sulla fisiologia e sulla produttività delle piante. Questo studio analizza la risposta morfologica e fisiologica alla siccità di due varietà di pomodoro, M82 e Red Setter; inoltre, delinea le prime fasi di un protocollo che permette di analizzare le modifiche epigenetiche in risposta alla siccità. Lo scopo di questo studio è quello di definire un protocollo di stress idrico e un protocollo di laboratorio per preparare dei campioni per l'analisi epigenomica ChIP-seq che possano essere facilmente replicati. La definizione di tali protocolli da seguire per l'applicazione di ulteriori stress è necessaria per studiare lo sviluppo di una “memoria" nelle piante, analizzare le differenze nella risposta a uno stress successivo e comprendere i meccanismi alla base della “memoria" dello stress.