In ambito biofisico, le pinzette ottiche sfruttano la luce per manipolare singole molecole di DNA, RNA o proteine, permettendo di studiare proprietà elastiche ed energetiche della molecola che sono difficilmente accessibili con i classici esperimenti biologici di volume. In questo lavoro di tesi, la tecnica delle pinzette ottiche è stata usata per studiare l'RNA messaggero della proteina timidilato sintasi (TSmRNA), che rappresenta un target noto nell'ambito della terapie oncologiche contro i tumori solidi. Nello specifico, sono state studiate le variazioni conformazionali di TSmRNA indotte dall'applicazione controllata di forze di pochi piconewton, allo scopo di determinare la sequenza di nucleotidi effettivamente coinvolta nel passaggio dallo stato nativo a quello denaturato della molecola. L'uso di opportuni modelli polimerici ha permesso di determinare la struttura delle molecole di RNA e come la presenza della proteina hTS nella soluzione influenzi le transizioni energetiche di TSmRNA.

Studio delle transizioni conformazionali di molecole di RNA tramite l'uso delle pinzette ottiche

VIOLA, DILETTA
2023/2024

Abstract

In ambito biofisico, le pinzette ottiche sfruttano la luce per manipolare singole molecole di DNA, RNA o proteine, permettendo di studiare proprietà elastiche ed energetiche della molecola che sono difficilmente accessibili con i classici esperimenti biologici di volume. In questo lavoro di tesi, la tecnica delle pinzette ottiche è stata usata per studiare l'RNA messaggero della proteina timidilato sintasi (TSmRNA), che rappresenta un target noto nell'ambito della terapie oncologiche contro i tumori solidi. Nello specifico, sono state studiate le variazioni conformazionali di TSmRNA indotte dall'applicazione controllata di forze di pochi piconewton, allo scopo di determinare la sequenza di nucleotidi effettivamente coinvolta nel passaggio dallo stato nativo a quello denaturato della molecola. L'uso di opportuni modelli polimerici ha permesso di determinare la struttura delle molecole di RNA e come la presenza della proteina hTS nella soluzione influenzi le transizioni energetiche di TSmRNA.
2023
Study of the conformational transitions of RNA molecules using optical tweezers
conformazione RNA
pinzette ottiche
TSmRNA
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/80500