Studio dei geni di risposta allo stress idrico in Helianthus annuus: approcci sperimentali per l'analisi epigenetica.

Il girasole (Helianthus annuus) è una delle principali colture oleaginose a livello globale, ma la sua resa è minacciata dai cambiamenti climatici, in particolare dallo stress idrico. Studi recenti hanno evidenziato che la risposta del girasole alla siccità dipende dallo stadio di sviluppo della pianta e coinvolge meccanismi adattativi ancora poco conosciuti. Tra questi le modifiche epigenetiche, come la metilazione degli istoni, potrebbero svolgere un ruolo chiave nella regolazione dell’espressione genica in risposta allo stress. In questo lavoro abbiamo ottimizzato un protocollo di immunoprecipitazione della cromatina (ChiP) per analizzare la distribuzione della modifica istonica H3K4me3 nel genoma di girasole, seguendo l’intero processo, dall’estrazione e sonicazione della cromatina fino all’immunoprecipitazione. L’efficacia del protocollo è stata valutata mediante qPCR su geni altamente espressi mentre il sequenziamento del DNA fornirà informazioni decisive sulla sua effettiva riuscita